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多肽自组装模拟：二苯丙氨酸纳米管成核自由能与临界核尺寸

多肽自组装模拟：二苯丙氨酸纳米管成核自由能与临界核尺寸

本项目用 well-tempered metadynamics 模拟二苯丙氨酸（diphenylalanine, FF）在 12 mM 有效浓度下的自组装成核过程。体系 48 ……
2026-09-16 
小分子化合物筛选：药效团匹配与 Tanimoto 相似度聚类

小分子化合物筛选：药效团匹配与 Tanimoto 相似度聚类

本项目基于某靶点结合口袋构建四特征药效团模型（氢键供体 HBD、氢键受体 HBA、疏水 HYD、芳环 AR），从商业化合物库中筛选候……
2026-09-16 
小分子自组装模拟：SDS 胶束形成动力学与临界胶束浓度

小分子自组装模拟：SDS 胶束形成动力学与临界胶束浓度

本项目用粗粒化 MARTINI 力场模拟 64 个 SDS 单体在水溶液中的自组装。体系共 310 K，用 GROMACS 运行 500 ns，分析径向密度分……
2026-09-16 
蛋白相互作用模拟

蛋白相互作用模拟

项目过程：蛋白复合物 A-B 的 100 ns 分子动力学 客户做抗体-抗原相互作用研究，需要定量判断复合物 A-B 的结合强度，以及结合……
2026-09-08 
分子间互相预测

分子间互相预测

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：分子间互相预测 客户要预测两个……
2026-09-04 
分子自组装模拟

分子自组装模拟

一、项目背景与科学问题 两亲性分子（如表面活性剂、嵌段共聚物）在水溶液中可自组装形成胶束、囊泡与液晶相等纳米结构。胶束……
2026-08-28 
计算模拟分子组装

计算模拟分子组装

一、项目背景与科学问题 嵌段共聚物（block copolymer）由化学性质不同的两段或多段聚合物链共价连接而成，其微相分离可自发组……
2026-08-28 
分子自组装计算

分子自组装计算

一、项目背景与科学问题 表面活性剂分子（如十二烷基硫酸钠，SDS）在溶液中超过一定浓度后会自发组装形成胶束，这一临界浓度称……
2026-08-27 
分子动力学模拟氢键

分子动力学模拟氢键

结合案例图分析，本文以这个含羟基体系氢键网络项目为例，讲氢键定义和 RDF 怎么用。这是一个含羟基体系氢键网络研究项目。客……
2026-08-26 
小分子自组装动力学模拟

小分子自组装动力学模拟

结合案例图分析，本文以这个两亲分子胶束形成项目为例，讲自组装模拟的采样与力场坑。这是一个两亲性小分子胶束形成研究项目。……
2026-08-26 
分子动力学建模

分子动力学建模

结合案例图分析，本文以这个肽链水溶液动力学项目为例，讲 MD 建模里决定成败的细节。这是一个生物分子溶液动力学项目的建模工……
2026-08-26 
高通量分子筛选

高通量分子筛选

高通量分子筛选（HTVS）的核心是用最低的单体系成本，在最短时间内从超大规模化合物库中剔除明显无效的分子。本项目在虚拟筛选……
2026-08-18 
计算模拟分子组装

计算模拟分子组装

计算模拟分子组装是连接分子相互作用和宏观材料性能的桥梁——你想知道两亲分子怎么排成胶束、多肽怎么缠成纤维，光靠实验观测往……
2026-08-11 
分子自组装模拟分析

分子自组装模拟分析

分子自组装模拟分析，是每一个想用模拟把”这些分子怎么自己拼成有序结构”看明白的人，迟早要碰的跨尺度难题。我刚……
2026-08-10 
小分子自组装动力学模拟

小分子自组装动力学模拟

小分子自组装动力学模拟，是每一个想看清楚”一堆分子怎么自己排成有序结构”的人最着迷也最头疼的课题。我刚做超分……
2026-08-06 
自组装分子结构预测

自组装分子结构预测

做 自组装分子结构预测 之前，我天真地想用全原子 MD 直接看一个两亲肽怎么聚成纤维。结果 200 ns 只看到两三个分子犹豫要不要……
2026-07-31 
分子自组装计算 — 氢键网络驱动的超分子层级组装模拟

分子自组装计算 — 氢键网络驱动的超分子层级组装模拟

为什么有些超分子体系能从单分子一直组装到宏观凝胶 脲基嘧啶酮（UPy）是超分子化学中的明星分子——它通过四重氢键形成极强的二……
2026-07-17 
分子自组装服务 — 临界胶束浓度CMC的模拟预测方法

分子自组装服务 — 临界胶束浓度CMC的模拟预测方法

CMC预测为什么不能靠”跑一跑看” 临界胶束浓度（CMC）是分子自组装服务中最常被咨询的参数之一。无论是表面活性剂……
2026-07-17 
多肽自组装计算 — 短肽β-sheet自组装的粗粒化MD模拟方法

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为什么模拟短肽自组装比想象中难得多 短肽自组装在生物材料、药物递送和纳米技术中有着广泛的应用前景。一个经典的例子是二苯……
2026-07-17 
分子自组装服务 — 从胶束形成到超分子结构的模拟实战

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分子自组装服务是计算化学中一个独特的方向——不模拟单个分子的行为，而是模拟大量分子如何自发组织成有序结构。从表面活性剂胶……
2026-07-15 
Materials Studio分子动力学模拟：Forcite、Amorphous Cell与COMPASS力场实战
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