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生物大分子自组装:脂质双层与蛋白质聚集的分子动力学模拟策略

生物大分子自组装:脂质双层与蛋白质聚集的分子动力学模拟策略

生物大分子自组装是自然界中最优雅的结构形成过程——脂质分子在水中自发排列成双层膜、蛋白质从无序状态折叠成功能构象、淀粉样……
2026-06-17 
自组装分子动力学模拟:两亲性嵌段共聚物的相行为预测

自组装分子动力学模拟:两亲性嵌段共聚物的相行为预测

嵌段共聚物的自组装比小分子表面活性剂复杂得多——它的每一个”构件”本身就是一个聚合物链段,链段的长度、比例、柔……
2026-06-16 
分子自组装模拟:一个表面活性剂胶束体系的微观结构分析

分子自组装模拟:一个表面活性剂胶束体系的微观结构分析

自组装是自然界中最精巧的组织方式之一——表面活性剂分子在溶液中自发地排列成胶束、囊泡、层状相等有序结构,不需要任何外部指……
2026-06-16 
蛋白质结构预测的实践困境——从同源建模到AlphaFold的经验复盘

蛋白质结构预测的实践困境——从同源建模到AlphaFold的经验复盘

蛋白质结构预测这个方向,如果从1960年代的Levinthal悖论算起,已经走了六十多年。2021年AlphaFold2在CASP14上把平均GDT-TS提……
2026-06-13 
CASTEP计算吸附能:平面波和原子轨道在氧化物表面吸附上的表现差在哪

CASTEP计算吸附能:平面波和原子轨道在氧化物表面吸附上的表现差在哪

CASTEP吸附能计算和VASP同属平面波DFT阵营,底层算法相近,但赝势库不同、默认参数不同、收敛行为也有微妙的差异。一个做光催……
2026-06-11 
蛋白结合位点预测:从序列到口袋的精准定位

蛋白结合位点预测:从序列到口袋的精准定位

做药物设计的人,大多在结合位点预测这一步踩过坑。预测出来的口袋看着挺合理,对接进去的结合模式也说得通,结果合成出来一测……
2026-06-08 
小分子自组装动力学模拟:聚集路径与形貌演化的完整追踪

小分子自组装动力学模拟:聚集路径与形貌演化的完整追踪

小分子自组装动力学模拟这个方向,门槛不算高,但要做到真正有物理参考价值的程度,需要对自组装热力学和动力学之间的权衡有清……
2026-04-28