分子动力学模拟|分子对接|分子自组装

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GROMACS是分子动力学领域使用最广泛的开源软件之一。结合自己跑过的多个体系，聊聊GROMACS计算的完整流程、关键参数设置与常见……

2026-04-28

LAMMPS是材料体系分子动力学模拟的主流工具，特别适合金属材料、聚合物、纳米材料等大规模体系的模拟。结合多个材料模拟项目经……

2026-04-28

高通量分子对接是虚拟筛选规模化最重要的工具，但把’跑得多’和’筛得准’画等号，是这个方向里最常见的……

2026-04-28

VASP是密度泛函理论(DFT)计算领域使用最广泛的软件之一。结合自己多年的VASP使用经验，聊聊从结构优化、电子自洽到态密度与能……

2026-04-28

蛋白药物小分子对接是计算机辅助药物设计里最成熟的标准流程之一，工具多、教程多、论文里用得更多。但正因为太成熟，很多人对……

2026-04-28

小分子自组装动力学模拟这个方向，门槛不算高，但要做到真正有物理参考价值的程度，需要对自组装热力学和动力学之间的权衡有清……

2026-04-28