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高分子动力学模拟：链构象标度律与扩散区制分析

高分子动力学模拟：链构象标度律与扩散区制分析

本项目采用粗粒化分子动力学模拟一条 500 珠的高分子链在良溶剂与 θ 溶剂中的动力学。力场为 Kremer-Grest 珠簧模型，截断半径……
2026-09-16 
蛋白酶体分子模拟

蛋白酶体分子模拟

项目过程：20S 蛋白酶体 500 ns 全原子动力学 客户研究蛋白酶体抑制剂，需要了解 20S 蛋白酶体在溶液中的动力学行为，特别是 β……
2026-09-08 
粗粒度分子动力学模拟

粗粒度分子动力学模拟

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：粗粒度分子动力学模拟 客户要做……
2026-09-04 
高分子分子动力学模拟

高分子分子动力学模拟

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：高分子分子动力学模拟 客户要做……
2026-09-04 
热力学模拟熔化焓

热力学模拟熔化焓

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：热力学模拟熔化焓 客户要的是纯……
2026-09-04 
分子动力学辐照模拟

分子动力学辐照模拟

一、项目背景与科学问题 核反应堆结构材料长期服役于高通量中子辐照环境，辐照产生的级联碰撞会在材料中引入大量空位与间隙原……
2026-09-03 
amber计算蛋白质折叠动力学

amber计算蛋白质折叠动力学

一、项目背景与科学问题 蛋白质的氨基酸序列如何折叠为确定的三维结构，是分子生物学的核心问题之一。微型蛋白Trp-cage由20个……
2026-09-03 
势函数理论计算

势函数理论计算

一、项目背景与科学问题 分子动力学（MD）模拟的可靠性从根本上取决于势函数（interatomic potential）的精度。势函数以解析形……
2026-09-02 
MD 分子动力学计算模拟

MD 分子动力学计算模拟

一、项目背景与科学问题 蛋白质在溶液中的三维结构与构象动力学决定其生物学功能。溶菌酶（lysozyme）是结构生物学研究的经典……
2026-08-31 
钙钛矿分子动力学模拟

钙钛矿分子动力学模拟

一、项目背景与科学问题 有机-无机杂化钙钛矿（如 CH₃NH₃PbI₃，MAPbI₃）凭借优异的光电性能（高吸收系数、长载流子寿命、低成……
2026-08-31 
晶体分子动力学模拟

晶体分子动力学模拟

一、项目背景与科学问题 晶体分子动力学（MD）模拟以原子/分子为基本单元，通过数值积分运动方程追踪粒子在晶体势场中的运动轨……
2026-08-28 
蛋白酶体分子模拟

蛋白酶体分子模拟

一、项目背景与科学问题 20S 蛋白酶体是真核细胞中负责蛋白质降解的核心分子机器，由四个堆叠的七元环（αββα）组成，形成中空……
2026-08-28 
从头计算分子动力学模拟

从头计算分子动力学模拟

一、项目背景与科学问题 从头算分子动力学（AIMD，Born-Oppenheimer MD）将第一性原理电子结构计算与分子动力学轨迹传播相结合……
2026-08-28 
GPCR 分子动力学模拟

GPCR 分子动力学模拟

一、项目背景与科学问题 G 蛋白偶联受体（GPCR）是人类基因组中最大的膜蛋白家族，介导约三分之一上市药物的药理作用。β₂-肾上……
2026-08-28 
分子动力学粗粒化模拟

分子动力学粗粒化模拟

一、项目背景与科学问题 生物膜是细胞与细胞器功能的基础，其结构性质（如单脂面积、膜厚度、脂质有序度）与膜蛋白功能密切相……
2026-08-27 
分子动力学模拟自由能计算

分子动力学模拟自由能计算

结合案例图分析，本文以这个构象转变自由能项目为例，讲 umbrella sampling 的窗口与重叠。这是一个构象转变自由能测定项目。……
2026-08-26 
蛋白结合位点模拟

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结合案例图分析，本文以这个抑制剂-靶点结合模式项目为例，讲动态信息和能量分解怎么找真关键残基。这是一个抑制剂-靶点结合模……
2026-08-26 
高通量分子筛选

高通量分子筛选

结合案例图分析，本文以这个催化剂先导化合物筛选项目为例，讲前置虚拟筛选为什么比硬算重要。这是一个催化剂先导化合物虚拟筛……
2026-08-26 
大分子分子动力学模拟

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结合案例图分析，第一张案例图横轴是模拟时间（ns），纵轴是RMSD（Å）。黑色曲线代表apo态（无配体），红色曲线代表holo态（配……
2026-08-25 
MOE分子模拟

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结合案例图分析，第一张案例图是配体周围空间的静电势映射。红色区域表示负静电势（亲核/富电子），蓝色区域表示正静电势（亲……
2026-08-25 
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