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多肽和蛋白结合：多肽-蛋白界面接触图谱与 MM-GBSA 能量分解

多肽和蛋白结合：多肽-蛋白界面接触图谱与 MM-GBSA 能量分解

本项目研究一条 14 残基多肽与目标蛋白的结合界面。通过 300 ns 显水 MD，提取 300 帧做 MM-GBSA 能量分解，并绘制界面接触图……
2026-09-16 
蛋白分子模拟对接：PD-1/PD-L1 界面结合模式与能量分解

蛋白分子模拟对接：PD-1/PD-L1 界面结合模式与能量分解

本项目通过分子对接与分子动力学模拟研究 PD-1 与 PD-L1 蛋白的相互作用。采用 ZDOCK/Rosetta 对接产生 54000 个刚体取向，经 ……
2026-09-16 
蛋白分子模拟对接

蛋白分子模拟对接

项目过程：蛋白-蛋白对接与能量漏斗分析 客户需要预测两个已知结构的蛋白如何形成复合物，没有实验复合物结构。他的目标是得到……
2026-09-08 
蛋白结合位点预测

蛋白结合位点预测

项目过程：螺旋蛋白的可药性口袋识别 客户拿到一条新解析的螺旋蛋白结构，不知道小分子该往哪里结合。他希望能先预测出潜在的……
2026-09-08 
分子对接筛选

分子对接筛选

项目过程：针对 EGFR 激酶的 2100 分子虚拟筛选 客户有一批从化合物库中挑选的 2100 个类药分子，想快速筛选出可能结合 EGFR ……
2026-09-08 
生物分子结构预测

生物分子结构预测

项目过程：四螺旋束蛋白的结构预测与质量评估 客户有一条新测序的蛋白序列，没有实验结构，想用计算预测一个可靠的三维模型，……
2026-09-08 
蛋白修饰位点预测

蛋白修饰位点预测

项目过程：300 残基底物磷酸化位点的机器学习预测 客户拿到一条 300 残基的底物蛋白序列，想快速定位可能的磷酸化位点。实验上……
2026-09-08 
分子对接预测

分子对接预测

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：分子对接预测 客户手上有 15 个……
2026-09-04 
多糖分子对接

多糖分子对接

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：多糖分子对接 客户研究的是寡糖……
2026-09-04 
小分子对接模拟

小分子对接模拟

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：小分子对接模拟 客户要做的是一……
2026-09-04 
分子对接和动力学模拟

分子对接和动力学模拟

一、项目背景与科学问题 计算机辅助药物设计通过在分子水平预测配体与靶蛋白的结合模式来加速先导化合物发现。分子对接可以快……
2026-09-03 
蛋白质分子动力学模拟HIV-1蛋白酶

蛋白质分子动力学模拟HIV-1蛋白酶

一、项目背景与科学问题 HIV-1蛋白酶是艾滋病病毒复制周期中的关键酶，负责切割病毒多聚蛋白前体，是抗艾滋病药物的核心靶点。……
2026-09-03 
分子对接自由能计算

分子对接自由能计算

一、项目背景与科学问题 结合自由能（binding free energy）是定量评价蛋白-配体相互作用强度的核心热力学量，直接关联药物分……
2026-08-31 
核酸小分子对接

核酸小分子对接

一、项目背景与科学问题 核酸（DNA/RNA）是许多小分子药物的作用靶点。小分子通过与 DNA 双螺旋的特定位点结合，可抑制基因转……
2026-08-28 
多肽分子对接模拟

多肽分子对接模拟

一、项目背景与科学问题 多肽-受体相互作用在信号转导、免疫识别与药物设计中扮演核心角色。多肽药物因高特异性与低毒性受到广……
2026-08-27 
分子对接位点

分子对接位点

结合案例图分析，本文以这个新靶点口袋识别项目为例，讲结合位点识别为什么是对接前置。这是一个新药靶点结合位点识别项目。客……
2026-08-26 
多糖分子对接

多糖分子对接

结合案例图分析，第一张案例图是一个蓝色椭圆表示的lectin domain，里面标注了几个氨基酸残基位点（aa）。一端是Glc-Man二糖链……
2026-08-25 
分子对接结合能

分子对接结合能

结合案例图分析，第一张案例图展示的是配体骨架，碳原子为深色圆球，氮为蓝色，氧为红色。可以看到配体与周围口袋残基形成了多……
2026-08-25 
alphafold2分子对接

alphafold2分子对接

我做过一个用 AlphaFold2 预测结构再做分子对接的项目。客户没有蛋白晶体结构，只有序列，但他想知道小分子能不能结合到某个潜……
2026-08-24 
多对多分子对接

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普通对接是一对一（一个配体对一个受体），但实际药物发现里常遇到”一组化合物（比如同源蛋白家族）对一组靶标”的……
2026-08-21 
同源建模和分子对接：从模板选择到对接验证的GPCR靶标完整流程
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