分子对接 | 虚拟筛选|蛋白配体相互作用分析

多对多分子对接：批量药物筛选的策略与陷阱

多对多分子对接不是把单靶点对接重复N次然后拼在一起。当一组化合物需要同时面对一组靶点蛋白时，流程设计的每个细节——从靶点……

2026-06-19

分子相互作用预测：从静电势图到结合自由能的多层级筛选方法

分子相互作用预测的终极问题是：两个分子会不会结合、怎么结合、结合多强。这个问题在药物设计中对应”配体能否识别靶点&……

2026-06-18

分子对接结合能：Vina Score到MM/PBSA的精度跃迁与能量拆解的本质差异

分子对接结合能——做完对接后输出的那个数字——你以为它是”结合能”，实际上它连结合能的物理单位（kcal/mol）对应的……

2026-06-18

同源建模和分子对接：从模板选择到对接验证的GPCR靶标完整流程

同源建模和分子对接的结合——先用序列相似性构建三维蛋白模型，再用分子对接预测配体结合模式——在结构生物学里是处理无晶体结构……

2026-06-18

生物分子对接：蛋白-蛋白与蛋白-DNA对接的方法抉择与柔性处理

生物分子对接和小分子对接听起来是同一件事，但实际操作的技术路线截然不同。小分子对接搜索的是一个小体积口袋内的配体嵌入构……

2026-06-17

分子对接怎么做：从蛋白准备到评分验证的完整链条与实操陷阱

分子对接怎么做这个问题，在药物设计圈子里几乎每个入门者都会搜。教程遍地都是，工具随手可用——AutoDock Vina免费开源，几行……

2026-06-17

蛋白质分子动力学模拟：一个酶-底物复合物的结合稳定性分析

蛋白质结构的静态图片告诉你的只是”可能长什么样”，但真正决定功能的是动态过程——蛋白如何柔性运动、底物如何进入……

2026-06-16

分子相互作用预测：非共价相互力的计算方法与适用边界

分子相互作用预测涉及的非共价力类型很多——氢键、疏水相互作用、静电相互作用、范德华力、阳离子-π相互作用、卤键——每一种力的……

2026-06-15

蛋白药物小分子对接服务：从靶点选择到先导化合物优化的计算辅助流程

蛋白药物小分子对接服务的价值定位很清晰：在实验合成和活性测试之前，用计算手段筛选数以万计的化合物，把候选范围缩小到百级……

2026-06-15

分子对接结合能角度预测：如何准确预测配体的结合取向

分子对接结合能角度预测比单纯的结合能打分更难——打分只需要给出一个数字，角度预测需要确定配体在结合口袋中的空间取向。同一……

2026-06-15

分子对接预测：从AutoDock到精准结合模式判断的实践之路

分子对接预测的核心目标很简单——在受体结合口袋里找到配体的最优结合构象，然后给出一个打分来评估结合强度。听起来像是一个&#……

2026-06-15

点突变预测蛋白互作——从结构到能量的计算策略

点突变预测蛋白互作，问题形式很简单：一个蛋白-蛋白复合物，给定某个点突变（比如p53的R175H），这个突变对复合物结合亲和力……

2026-06-13

分子动力学模拟在蛋白-配体对接中的应用——从静态对接到动态结合

分子动力学模拟对接——把MD模拟和对接结合起来——解决的是传统刚性对接的一个根本缺陷：蛋白在配体结合过程中会调整构象，这个&#……

2026-06-13

分子对接预测在药物虚拟筛选中的精度控制与验证策略

分子对接预测在药物发现管线里的位置，通常是高通量虚拟筛选的第一步。一个典型的项目流程是：从百万级化合物库出发，用对接打……

2026-06-13

分子对接动力学模拟：静态对接只看锁和钥匙，动力学模拟才看插进去之后会不会晃

对接软件给你一个打分，说这个分子对靶点的亲和力是-9.2 kcal/mol。打分漂亮、氢键数够、π-π堆积齐全——放到评审PPT里完全拿得……

2026-06-11

分子对接和分子模拟：从AutoDock Vina到MD验证的完整工作流

分子对接和分子模拟：从AutoDock Vina到MD验证的完整工作流分子对接和分子模拟，在药物设计工作流里是两个阶段——对接负责快速……

2026-06-01

生物分子结构预测：从序列到三维构象的计算之路

拿到一条全新的蛋白序列，想知道它的三维结构——这在十几年前意味着至少半年的实验周期，结晶、衍射、解析，每一步都可能卡住。……

2026-05-26

分子对接的结合能：评分函数精度、构象采样与MM/PBSA后处理的完整评估

分子对接的结合能是整个计算机辅助药物设计(CADD)流程中最容易被误用的数值。对接软件输出一个结合能数值——AutoDock Vina给出……

2026-05-26

分子对接自由能计算

分子对接做了这么多年，最大的感受是：结合自由能不是算出来的，是选出来的。同样的体系，用不同的对接软件、不同的评分函数、……

2026-05-20

蛋白药物小分子对接：结合姿态与亲和力评估的完整链条

蛋白药物小分子对接是计算机辅助药物设计里最成熟的标准流程之一，工具多、教程多、论文里用得更多。但正因为太成熟，很多人对……

2026-04-28

蛋白药物小分子对接：结合姿态与亲和力评估的完整链条

每日精选

猜你喜欢

多对多分子对接：批量药物筛选的策略与陷阱

分子相互作用预测：从静电势图到结合自由能的多层级筛选方法

分子对接结合能：Vina Score到MM/PBSA的精度跃迁与能量拆解的本质差异

同源建模和分子对接：从模板选择到对接验证的GPCR靶标完整流程

生物分子对接：蛋白-蛋白与蛋白-DNA对接的方法抉择与柔性处理

分子对接怎么做：从蛋白准备到评分验证的完整链条与实操陷阱

蛋白质分子动力学模拟：一个酶-底物复合物的结合稳定性分析

分子相互作用预测：非共价相互力的计算方法与适用边界

蛋白药物小分子对接服务：从靶点选择到先导化合物优化的计算辅助流程

分子对接结合能角度预测：如何准确预测配体的结合取向

分子对接预测：从AutoDock到精准结合模式判断的实践之路

点突变预测蛋白互作——从结构到能量的计算策略

分子动力学模拟在蛋白-配体对接中的应用——从静态对接到动态结合

分子对接预测在药物虚拟筛选中的精度控制与验证策略

分子对接动力学模拟：静态对接只看锁和钥匙，动力学模拟才看插进去之后会不会晃

分子对接和分子模拟：从AutoDock Vina到MD验证的完整工作流

生物分子结构预测：从序列到三维构象的计算之路

分子对接的结合能：评分函数精度、构象采样与MM/PBSA后处理的完整评估

分子对接自由能计算

蛋白药物小分子对接：结合姿态与亲和力评估的完整链条

每日精选

猜你喜欢

精彩图片

TEM在催化材料表征中的前沿应用

LAMMPS粘度计算：平衡态与NEMD方法的工业润滑液案例

DFT+U计算Co₃O₄带隙——U值不只是一参数，它是一个物理判断

薄膜弹性模量测试：纳米压痕法的三步测准路线与常见陷阱

热门标签