高通量分子筛选

高通量分子筛选（HTVS）的核心是用最低的单体系成本，在最短时间内从超大规模化合物库中剔除明显无效的分子。本项目在虚拟筛选管线的最前端部署 HTVS，作为连接百万级库与精筛阶段的过滤器。下文说明 HTVS 的工程实现、精度取舍与典型产出。

HTVS 与常规虚拟筛选的区别

常规对接对单个分子要做构象搜索 + 打分，耗时在秒级到分钟级；HTVS 通过预计算网格（预先算好受体势能场） + 快速近似打分，把单分子耗时压到毫秒级，从而能在数小时内扫完数百万化合物。代价是精度下降，所以它只适合”粗筛过滤”，不适合直接定结论。

本项目的 HTVS 实现

1. 受体网格预计算：用 Glide 的 HTVS 模式或 Vina 固定网格，将受体的静电、范德华场烘焙进网格，配体只需在网格上滑动评分。
2. 构象库预生成：对库分子先做 Open Babel / RDKit 多构象展开，避免筛选时实时搜索拖慢速度。
3. 分级漏斗：HTVS（top 5%）→ SP 标准精度（top 1%）→ XP 精确精度（top 0.1%），每一级都丢弃大部分，只把最可疑的送进更贵的下一步。
4. 多样性保持：在 top 列表里做骨架聚类，避免最终 hit 全是一个骨架的近亲。

精度取舍的代价

HTVS 打分对柔性配体、诱导契合、溶剂效应的描述都很粗糙。本项目遇到过 HTVS 高分但在 SP 阶段掉到中游的配体——柔性糖基在 HTVS 里被锁死成不利构象却仍获高分。因此 HTVS 的召回率比准确率重要：宁可多放一些假阳性进下一轮，也不能在粗筛阶段漏掉真 hit。

典型产出与量级

工程边界

HTVS 依赖受体刚性假设，对变构口袋、显著构象变化的靶点会漏筛。本项目对这类靶点会改用诱导契合对接或元动力学作为补充，而非单纯依赖刚性 HTVS。高通量筛选与后续分子对接的衔接细节见本站的分子对接计算栏目。更多计算服务见科研学术网首页。