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首页 > 分子动力学模拟 > 分子对接 (第 3 页)
分子对接结合能

分子对接结合能

分子对接结合能，是每一个做完对接、想把这个”结合有多强”从排名数字变成可解释能量的人，必须跨的一道坎。我刚学……
2026-08-10 
核酸小分子对接

核酸小分子对接

核酸小分子对接，是每一个想算清楚”这个小分子和 DNA/RNA 到底怎么结合”的人，踩坑最多的对接方向。我刚做 G-四链……
2026-08-10 
分子对接筛选

分子对接筛选

分子对接筛选，是每一个做虚拟筛选、想从几十万化合物里捞出几个真苗头的人，绕不开的第一道漏斗。我刚做筛选项目时，直接用默……
2026-08-10 
生物分子结构预测

生物分子结构预测

生物分子结构预测，是每一个想用计算把”这段序列到底折成什么样”搞清楚的人，这两年绕不开的革命性工具。我刚用 A……
2026-08-10 
分子模拟对接

分子模拟对接

分子模拟对接，是每一个想把”谁和谁结合、怎么结合”用计算说清楚的人绕不开的基础框架。我刚入行那会儿，把”……
2026-08-06 
蛋白分子对接预测

蛋白分子对接预测

蛋白分子对接预测，是每一个想用计算替实验筛先导化合物的人必须跨过的一道坎。我刚接触对接那会儿，把配体往蛋白活性口袋里一……
2026-08-06 
aimd从头算分子动力学模拟

aimd从头算分子动力学模拟

aimd从头算分子动力学模拟，是每一个想让原子”自己动起来”却又舍不得放弃量子精度的人最终会选的路线。我刚接触 A……
2026-08-06 
分子对接模拟

分子对接模拟

分子对接模拟是药物虚拟筛选的第一道闸门。我刚做项目时，把一个靶点跑了三十万化合物的对接，Top100里挑了十个做实验，结果一……
2026-08-04 
分子对接与动力学模拟

分子对接与动力学模拟

分子对接与动力学模拟联用，是药物设计和蛋白-配体研究里我最常用的组合拳。但很多人以为对接完了就完事，我早年也这么干，直……
2026-08-04 
界面分子动力学模拟

界面分子动力学模拟

界面分子动力学模拟是块硬骨头。我第一次算水和石墨烯的固液界面，跑完发现水分子在界面排成了怪异的双层，润湿角算出来离谱，……
2026-08-04 
聚合物分子动力学模拟

聚合物分子动力学模拟

聚合物分子动力学模拟最怕算完了却不像聚合物。我刚入行时用通用力场随手建了条聚乙烯链，跑完发现链缠结全无、玻璃化转变温度……
2026-08-04 
分子结构预测

分子结构预测

我第一次做 分子结构预测是给一个柔性八肽找全局最小构象，用系统搜索跑了上万个构象，挑了最低的那个去做 MD，结果 MD 一开始……
2026-08-03 
分子对接大概多少钱

分子对接大概多少钱

被问”分子对接大概多少钱”时，我最怕对方只丢一句”对接一个分子多少钱”。因为对接不是标准件——靶点要……
2026-07-31 
yasara分子动力学模拟

yasara分子动力学模拟

我第一次用 yasara分子动力学模拟 是因为客户那边只有 YASARA 的 license，且想要一个”开箱即用”的蛋白-配体稳定……
2026-07-31 
分子对接自组装

分子对接自组装

做 分子对接 自组装 的契机，是客户想设计一个环糊精包结一个药物分子的超分子系统。我一开始当成普通靶点对接，把药物塞进空……
2026-07-31 
分子对接预测

分子对接预测

我第一次做 分子对接预测 是把一个客户给的 200 个化合物批量 dock 到靶点，按打分排了个序交差。结果实验验证只命中 3 个，客……
2026-07-31 
酶的分子对接：从活性口袋识别到催化机理验证的专项目路径

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酶的分子对接是分子对接里最磨人的一类——普通蛋白只要找结合口袋，酶还得兼顾催化机理，活性中心往往柔性大、有水桥、有金属辅……
2026-07-30 
候选药物分子筛选：从虚拟筛选到实验验证的递进式漏斗

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候选药物分子筛选是药物发现的第一道关，但新手最容易把它做成”跑一遍对接、挑分数最高的十个”。真实项目里，对接……
2026-07-30 
代做分子动力学模拟：从需求沟通到交付汇报的全流程经验

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代做分子动力学模拟这几年需求暴涨，但十单里有六单卡在”需求没对齐”上——客户说”帮我模拟一下这个分子̶……
2026-07-30 
蛋白与小分子互作：从分子对接到自由能验证的机理研究路径

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蛋白与小分子互作是药物发现和酶调控研究的核心，但它的坑不在”算出个结合模式”，而在”算出的结合模式你敢……
2026-07-30 
同源建模和分子对接：从模板选择到对接验证的GPCR靶标完整流程
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