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首页 > 分子动力学模拟 > lammps计算 (第 3 页)
径向分布函数模拟计算:解析微观结构的核心统计工具

径向分布函数模拟计算:解析微观结构的核心统计工具

径向分布函数(Radial Distribution Function, RDF)是分子模拟中描述微观结构特征的核心统计量,通过量化粒子间距的分布规律……
2026-07-10 
LAMMPS粗粒化建模:从全原子到粗粒化的高效模拟策略

LAMMPS粗粒化建模:从全原子到粗粒化的高效模拟策略

粗粒化(Coarse-Grained, CG)建模是分子动力学模拟中跨越时间与空间尺度限制的核心技术,通过将多个原子合并为一个”珠……
2026-07-10 
均方根计算:蛋白质构象稳定性的量化评估方法

均方根计算:蛋白质构象稳定性的量化评估方法

均方根计算在分子动力学分析中是基础但关键的指标,但参考构象选择影响结果显著、拟合原子集定义不统一、阈值判定标准缺乏行业……
2026-07-09 
LAMMPS计算密度:从均匀体相到界面密度分布

LAMMPS计算密度:从均匀体相到界面密度分布

密度是分子动力学模拟中最基础也是最容易出错的物理量之一。在均匀体系中,密度计算直截了当——总质量除以总体积;但在非均匀体……
2026-07-08 
LAMMPS计算原子应力:从Virial公式到应力分布可视化

LAMMPS计算原子应力:从Virial公式到应力分布可视化

原子级应力是分子动力学中描述局部力学状态的核心量。与有限元中的连续应力场不同,LAMMPS输出的原子应力是离散的、与体积定义……
2026-07-08 
LAMMPS计算表面张力:从力学定义到多方法对比

LAMMPS计算表面张力:从力学定义到多方法对比

表面张力是液体界面的核心热力学性质,在分子动力学模拟中可通过多种路径获得。LAMMPS提供了从压力张量分析到界面构型拟合等不……
2026-07-08 
LAMMPS模拟计算:从输入文件到结果分析的全流程经验

LAMMPS模拟计算:从输入文件到结果分析的全流程经验

LAMMPS是材料科学领域使用最广泛的MD软件——免费、开源、并行效率高、力场支持全面。但LAMMPS的学习曲线陡峭,输入脚本语法复杂……
2026-07-07 
LAMMPS计算势函数:力场选择与参数标定实战经验

LAMMPS计算势函数:力场选择与参数标定实战经验

在LAMMPS分子动力学模拟中,势函数(力场)是最关键的输入——它决定了模拟结果的物理可信度。选错力场,跑再多步也是垃圾数据。……
2026-07-07 
LAMMPS计算自由能:自由能微扰与积分方法

LAMMPS计算自由能:自由能微扰与积分方法

LAMMPS计算自由能概述 自由能是热力学中描述体系稳定性和相平衡的核心物理量。在分子模拟中,自由能计算用于预测材料相稳定性……
2026-07-06 
径向分布函数理论计算:RDF的计算方法与应用

径向分布函数理论计算:RDF的计算方法与应用

径向分布函数概述 径向分布函数(Radial Distribution Function, RDF),又称对相关函数(Pair Correlation Function),是描……
2026-07-06 
LAMMPS粗粒化建模:粗粒化分子动力学方法

LAMMPS粗粒化建模:粗粒化分子动力学方法

粗粒化(Coarse-Grained, CG)分子动力学是将多个原子合并为一个”珠子”(bead)来表示的简化模拟方法。通过降低体……
2026-07-06 
LAMMPS代算声子谱:分子动力学声子谱计算方法

LAMMPS代算声子谱:分子动力学声子谱计算方法

声子谱的物理意义 声子谱(Phonon Spectrum)是描述晶体中晶格振动频率与波矢关系的物理量,是分析材料热力学稳定性、热膨胀……
2026-07-06 
lammps计算弹性模量:从原子势函数到应力应变曲线的实践路径

lammps计算弹性模量:从原子势函数到应力应变曲线的实践路径

lammps计算弹性模量是分子动力学在材料力学性能预测中的核心应用之一。当项目需要评估一种新型多主元合金的刚度参数时,这条从……
2026-07-04 
LAMMPS计算揭示纳米晶铜拉伸变形:位错演化与晶界行为的原子尺度分析

LAMMPS计算揭示纳米晶铜拉伸变形:位错演化与晶界行为的原子尺度分析

LAMMPS计算在这个纳米晶力学项目中扮演着不可替代的角色——它需要在原子尺度上还原纳米晶铜在单轴拉伸下的塑性变形全过程。项目……
2026-07-03 
LAMMPS计算自由能:伞形采样与自由能微扰的实战方案

LAMMPS计算自由能:伞形采样与自由能微扰的实战方案

自由能计算是分子动力学模拟中难度最高也最具应用价值的技术方向之一。在药物-靶点结合亲和力预测、离子溶剂化自由能计算和相……
2026-06-30 
LAMMPS计算扩散系数:从Einstein关系式到多尺度扩散分析

LAMMPS计算扩散系数:从Einstein关系式到多尺度扩散分析

扩散系数是分子动力学模拟中最常计算的输运性质之一,它定量描述了粒子在体系中的迁移速率。在电池电解质、离子导体、聚合物链……
2026-06-30 
LAMMPS计算径向分布函数:从g(r)提取微观结构信息的完整方法

LAMMPS计算径向分布函数:从g(r)提取微观结构信息的完整方法

径向分布函数(Radial Distribution Function, g(r))是分子动力学模拟中最基础也最重要的结构分析工具,它描述了以某个粒子为……
2026-06-30 
LAMMPS粗粒化建模:从全原子映射到介观模拟的力场构建方法

LAMMPS粗粒化建模:从全原子映射到介观模拟的力场构建方法

在分子动力学模拟中,全原子模型虽然精度高,但计算成本限制了可模拟的时间和空间尺度。粗粒化(Coarse-Grained, CG)建模通过……
2026-06-30 
拉伸动力学模拟:在力的作用下揭示生物大分子的机械性质

拉伸动力学模拟:在力的作用下揭示生物大分子的机械性质

拉伸动力学模拟的第一个实验场景,往往来自一个朴素的疑问:如果把一个蛋白质分子的两端慢慢拉开,它会怎样回应?这个问题的答……
2026-06-28 
LAMMPS计算层错能:晶界、孪晶与位错核心结构的能量分析

LAMMPS计算层错能:晶界、孪晶与位错核心结构的能量分析

层错能(Stacking Fault Energy, SFE)是预测金属塑性变形机制(位错滑移 vs 孪晶)的核心参数。本项目在计算Al的层错能时,初……
2026-06-26