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首页 > 分子动力学模拟 > VASP计算 (第 2 页)
电解液模拟计算 — 锂离子电池电解液溶剂化结构与离子输运的MD模拟

电解液模拟计算 — 锂离子电池电解液溶剂化结构与离子输运的MD模拟

电解液模拟计算是锂离子电池研发中越来越离不开的工具。实验上测离子电导率用EIS（电化学阻抗谱），测溶剂化数用拉曼或NMR——但……
2026-07-21 
怎么做分子动力学模拟 — 从体系搭建到轨迹分析的零基础实战指南

怎么做分子动力学模拟 — 从体系搭建到轨迹分析的零基础实战指南

怎么做分子动力学模拟——这个问题我在知乎上被问过不下50次。回答一般有两种套路：一种是甩给你GROMACS官方教程链接（Lysozyme ……
2026-07-21 
CADD计算 — 计算机辅助药物设计的分子模拟全管线实战

CADD计算 — 计算机辅助药物设计的分子模拟全管线实战

CADD计算（Computer-Aided Drug Design）说的不是单一技术——是一条从靶点结构到候选化合物的完整管线。我接过一个案例：客户用……
2026-07-21 
MS计算分子动力学 — Materials Studio Forcite模块从建模到平衡态的完整实战

MS计算分子动力学 — Materials Studio Forcite模块从建模到平衡态的完整实战

MS计算分子动力学说的就是用Materials Studio的Forcite模块跑经典MD模拟。和GROMACS/AMBER/LAMMPS这些开源引擎不同，MS把建模……
2026-07-21 
VASP做分子动力学模拟 — 第一性原理分子动力学的精度边界与实践路径

VASP做分子动力学模拟 — 第一性原理分子动力学的精度边界与实践路径

VASP做分子动力学模拟（即AIMD，Ab Initio Molecular Dynamics）和经典MD的本质区别是：力不是从经验势函数来的，而是从密度泛……
2026-07-20 
分子动力学模拟代算 — 科研用户的MD外包服务选择指南

分子动力学模拟代算 — 科研用户的MD外包服务选择指南

分子动力学模拟代算的行业现状是：市面上提供”MD代做”的个体和团队有数十家，但真正能把蛋白-配体体系的MM-PBSA结……
2026-07-20 
蛋白质分子动力学模拟 — 折叠路径、构象疾病与突变效应的原子级剖析

蛋白质分子动力学模拟 — 折叠路径、构象疾病与突变效应的原子级剖析

蛋白质分子动力学模拟的一个延伸应用是将MD作为”原子显微镜”来观察蛋白质自身的生命——它是如何折叠的、在什么条件……
2026-07-20 
药物分子动力学模拟 — 从苗头化合物到临床候选的MD全链路应用

药物分子动力学模拟 — 从苗头化合物到临床候选的MD全链路应用

药物分子动力学模拟在药物发现流程中的角色正从”可选工具”升级为”AI/对接/FEP三位一体”的核心组件。……
2026-07-20 
分子动力学模拟报价 — 按体系规模和计算内容分档的预算参考

分子动力学模拟报价 — 按体系规模和计算内容分档的预算参考

分子动力学模拟报价是科研用户在申请经费时最头疼的问题之一——”我也不知道一个MD模拟值多少钱”。2000块钱跑个蛋白……
2026-07-20 
分子动力学和蛋白质模拟 — 从力场适应性到构象采样的系统评估

分子动力学和蛋白质模拟 — 从力场适应性到构象采样的系统评估

分子动力学和蛋白质模拟的关系不是”选一个力场→跑一条轨迹→画个RMSD”的一条直线，而是一个多维决策空间。膜蛋白和……
2026-07-20 
分子动力学模拟势函数 — 从Lennard-Jones到机器学习势的精度博弈

分子动力学模拟势函数 — 从Lennard-Jones到机器学习势的精度博弈

分子动力学模拟势函数的选错代价可能比算力不足更大。用一个为惰性气体设计的LJ势（Lennard-Jones）去模拟金属——你一个字都别……
2026-07-20 
晶体分子动力学模拟 — 晶界建模与位错-缺陷相互作用的原子级分析

晶体分子动力学模拟 — 晶界建模与位错-缺陷相互作用的原子级分析

晶体分子动力学模拟和生物系统的MD有本质的区别：生物体系关心的是氢键网络和疏水接触——作用力在kcal/mol量级；晶体体系关心的……
2026-07-20 
分子动力学模拟服务 — 从体系搭建到数据分析的全流程项目指南

分子动力学模拟服务 — 从体系搭建到数据分析的全流程项目指南

分子动力学模拟服务的采购和验收比纯软件操作的仿真服务复杂——因为MD的项目边界更模糊。一个”帮我算一下这个蛋白的RMSF&……
2026-07-20 
分子动力学冲击模拟 — 从冲击波加载到Hugoniot曲线提取的全流程

分子动力学冲击模拟 — 从冲击波加载到Hugoniot曲线提取的全流程

分子动力学冲击模拟和常规MD有一个核心区别：常规MD研究的是平衡态或近平衡态——温度、压力恒定，体系在相空间缓慢采样。冲击模……
2026-07-20 
分子动力学溶解模拟 — 溶剂化建模与溶质-溶剂相互作用分析

分子动力学溶解模拟 — 溶剂化建模与溶质-溶剂相互作用分析

分子动力学溶解模拟的第一道关口不是算不准——是盒子太小。溶质分子在一个6 nm的立方盒子里，溶质”看到”的溶剂行为……
2026-07-20 
吉布斯自由能计算 — 从热力学基础到相图预测的实战复盘

吉布斯自由能计算 — 从热力学基础到相图预测的实战复盘

吉布斯自由能计算是热力学分析中最核心的工具之一，直接决定化学反应的自发性判断、相稳定性分析和材料设计方向。在做合金相图……
2026-07-18 
结合自由能计算 — 从MM-PBSA到炼金术变换的精度博弈

结合自由能计算 — 从MM-PBSA到炼金术变换的精度博弈

结合自由能计算的本质问题不是”能不能算”，而是”算的精度够不够用于决策”。MM-PBSA/GBSA一套流程跑下……
2026-07-18 
MD模拟价格 — 分子动力学计算费用的全成本构成与报价逻辑

MD模拟价格 — 分子动力学计算费用的全成本构成与报价逻辑

为什么市面上的MD模拟报价从几百到几万不等 很多客户第一次咨询MD模拟价格时都有一个共同困惑：为什么不同服务商的报价差异这……
2026-07-17 
平衡态分子动力学模拟 — 弛豫时间如何量化，一个被低估的判定标准

平衡态分子动力学模拟 — 弛豫时间如何量化，一个被低估的判定标准

“看着平衡了”不等于真的平衡了 在分子动力学模拟中，判断体系是否达到平衡态是每个研究者都面临的问题。绝大多数……
2026-07-17 
范德华力理论计算 — vdW-DF泛函家族从optB86b到SCAN+rVV10的演进之路

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为什么”标准”DFT算不准色散力 故事要从2015年说起。当时我们课题组在尝试计算一个有机半导体晶体（并五苯）的晶格……
2026-07-17 
VASP计算全流程：从结构优化到电子结构分析的经验总结
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VASP计算全流程：从结构优化到电子结构分析的经验总结

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