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首页 > 分子动力学模拟 > VASP计算 (第 4 页)
分子动力学自由能计算:蛋白-配体结合自由能的伞形采样路径

分子动力学自由能计算:蛋白-配体结合自由能的伞形采样路径

分子动力学自由能计算在药物筛选中是核心手段,但采样窗口设置不统一、势均值计算精度依赖采样充分性、力场参数对结果影响显著……
2026-07-09 
模拟计算分子动力学:从入门到精通的实战经验

模拟计算分子动力学:从入门到精通的实战经验

分子动力学(MD)模拟是连接微观与宏观的桥梁——从原子运动轨迹出发,计算扩散系数、热导率、力学性质等宏观物理量。无论你用的是……
2026-07-07 
MS分子动力学模拟:Forcite模块实战经验指南

MS分子动力学模拟:Forcite模块实战经验指南

Materials Studio的Forcite模块是很多同学接触分子动力学的第一个工具。相比LAMMPS的命令行操作,Forcite的图形界面让建模和设……
2026-07-07 
VASP计算分子动力学模拟:AIMD实战经验全分享

VASP计算分子动力学模拟:AIMD实战经验全分享

通常说到分子动力学(MD),大家首先想到LAMMPS或GROMACS——经典力场MD。但在某些场景下,力场无法描述化学键断裂和电子结构变化……
2026-07-07 
均方根偏差计算:RMSD在分子模拟中的应用

均方根偏差计算:RMSD在分子模拟中的应用

均方根偏差(Root Mean Square Deviation, RMSD)是衡量两组数据或结构之间差异的标准统计量。在分子模拟中,RMSD用于量化分子……
2026-07-06 
VASP怎么计算:从输入文件到结果分析的完整入门指南

VASP怎么计算:从输入文件到结果分析的完整入门指南

VASP怎么计算——这个问题几乎是每一个计算材料学初学者面对的第一个门槛。VASP(Vienna Ab-initio Simulation Package)是密度……
2026-07-04 
分子动力学计算模拟:力场选取、系综控制与结果验证的实践指南

分子动力学计算模拟:力场选取、系综控制与结果验证的实践指南

分子动力学计算模拟(MD)是连接微观相互作用与宏观物性的核心工具,但在实际项目中,从力场选取到结果验证的每一步都可能成为……
2026-07-04 
VASP计算结合能:从参数设置到结果验证的完整流程

VASP计算结合能:从参数设置到结果验证的完整流程

VASP计算结合能在材料模拟领域几乎是评估结构稳定性的”标配”操作,但真正做起来远没有手册上写的那么轻松。这个项……
2026-07-04 
vasp计算自由能:振动熵贡献与准谐近似的精度路径

vasp计算自由能:振动熵贡献与准谐近似的精度路径

vasp计算自由能的需求,往往出现在那些需要预测材料热力学稳定性的课题中。这个项目在研究钛酸锶(SrTiO3)的高温相变行为时,……
2026-07-04 
结合能计算:从催化剂筛选到吸附构型验证的关键标尺

结合能计算:从催化剂筛选到吸附构型验证的关键标尺

结合能计算在多相催化项目里几乎扮演着”裁判”的角色——一个候选材料值不值得继续做实验,往往先看它的吸附结合能落……
2026-07-03 
分子动力学模拟计算在蛋白质-配体结合自由能预测中的力场依赖性与采样挑战

分子动力学模拟计算在蛋白质-配体结合自由能预测中的力场依赖性与采样挑战

分子动力学模拟计算最让人焦虑的时刻,往往不是体系建好了、参数设好了、生产运行开始了——而是在你分析了五十纳秒的轨迹之后,……
2026-07-03 
高分子材料分子动力学模拟:力场选择、链动力学与力学响应分析

高分子材料分子动力学模拟:力场选择、链动力学与力学响应分析

高分子材料的多尺度结构和复杂链动力学特性使其分子模拟面临独特的挑战。与金属和简单分子晶体不同,高分子体系在空间尺度上跨……
2026-07-02 
VASPKIT计算吉布斯自由能:从声子谱到热力学量的完整流程

VASPKIT计算吉布斯自由能:从声子谱到热力学量的完整流程

在材料热力学稳定性评估和相图计算中,吉布斯自由能G(T) = H(T) – TS(T)是核心物理量。标准DFT计算仅提供0 K下的静态能……
2026-06-30 
结构预测建模:材料基因组方法在新材料设计中的实战应用

结构预测建模:材料基因组方法在新材料设计中的实战应用

结构预测建模是计算材料科学中”从原子到材料”逆向设计的核心环节。传统材料研究依赖实验试错发现新材料,而结构预……
2026-06-30 
LAMMPS计算自由能:热力学积分与Bennett接受率法的精度对比及最佳实践

LAMMPS计算自由能:热力学积分与Bennett接受率法的精度对比及最佳实践

在高校科研院所的分子动力学模拟实践中,LAMMPS计算自由能一直是困扰众多研究组的核心难题。自由能(Free Energy, ΔG)是判断……
2026-06-29 
HOMO能级理论计算:从DFT泛函比较到固态效应的多尺度修正策略

HOMO能级理论计算:从DFT泛函比较到固态效应的多尺度修正策略

近年来,随着有机光电材料(有机光伏、有机发光二极管、有机场效应晶体管)的快速发展,HOMO能级理论计算已经成为大量硕博论文……
2026-06-29 
HOMO能级计算服务:Gaussian软件在有机半导体材料能级预测中的实战应用

HOMO能级计算服务:Gaussian软件在有机半导体材料能级预测中的实战应用

在高校科研院所的有机光电材料研发实践中,HOMO能级计算服务一直是困扰众多研究组的核心难题。不同泛函、不同基组、不同溶剂化……
2026-06-29 
晶体分子动力学模拟:从原子尺度理解固体材料的动态行为

晶体分子动力学模拟:从原子尺度理解固体材料的动态行为

晶体分子动力学模拟的世界,与生物大分子的模拟环境有着截然不同的气质。有序的晶格、周期性的边界、对称群约束下的原子位移,……
2026-06-28 
分子动力学理论计算:从牛顿方程到生物分子模拟的底层逻辑

分子动力学理论计算:从牛顿方程到生物分子模拟的底层逻辑

分子动力学理论计算的出发点是牛顿第二定律。每个原子在势能场的梯度驱使下加速、位移、与其他原子发生碰撞,这套决定原子轨迹……
2026-06-28 
分子计算模拟:从力场选择到动力学行为预测的完整技术路径

分子计算模拟:从力场选择到动力学行为预测的完整技术路径

分子计算模拟在这个项目里卡了整整三周,原因追踪到最后,是力场参数与研究对象之间的适配性被低估了。项目本身并不复杂:一条……
2026-06-28