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热门搜索： 模拟计算，理论计算
gromacs计算 lammps计算 VASP计算 分子对接 分子自组装
大分子结构核磁预测：二级化学位移与实验化学位移关联

大分子结构核磁预测：二级化学位移与实验化学位移关联

本项目基于 120 个残基的蛋白结构预测 ¹³Cα 与 ¹³Cβ 二级化学位移，并与 BMRB 实验值对比。使用 SHIFTS/SHIFTX2 等经验模型，……
2026-09-16
小分子高通量筛选：120 万化合物七级漏斗与富集因子分析

小分子高通量筛选：120 万化合物七级漏斗与富集因子分析

本项目针对某激酶靶点建立 120 万化合物虚拟筛选流程。流程为七级漏斗：虚拟库→药效团过滤→分子对接→MM-GBSA 重打分→聚类→ADME……
2026-09-16
界面分子动力学模拟：二氧化硅/水界面水化层结构与动力学

界面分子动力学模拟：二氧化硅/水界面水化层结构与动力学

本项目构建羟基化二氧化硅（001）表面与 TIP3P 水的界面体系，共 42000 个水分子，温度 300 K，NVT 系综。通过 GROMACS 或 LAM……
2026-09-16
高斯分子动力学模拟

高斯分子动力学模拟

一、项目背景与科学问题 从头算分子动力学（AIMD）将电子结构计算与经典力学轨迹传播相结合，每一步都在当前原子构型下重新求……
2026-08-31
GROMACS分子动力学模拟的性能调优与并行计算

GROMACS分子动力学模拟的性能调优与并行计算

性能优化的层次结构 GROMACS是开源MD软件中性能最强的之一，但默认配置往往只能发挥50-70%的硬件潜力。本项目中遇到过这样的情……
2026-08-17
GROMACS分子动力学模拟的性能调优与并行计算

GROMACS分子动力学模拟的性能调优与并行计算

性能优化的层次结构 GROMACS是开源MD软件中性能最强的之一，但默认配置往往只能发挥50-70%的硬件潜力。本项目中遇到过这样的情……
2026-08-13
gpcr分子动力学模拟

gpcr分子动力学模拟

gpcr分子动力学模拟是膜蛋白计算里最考验耐心的一类——GPCR 嵌在脂质双分子层里，构象变化决定了它怎么识别配体、怎么激活下游……
2026-08-11
gromacs自由能计算

gromacs自由能计算

我第一次做 gromacs自由能计算是算一个药物分子的水合自由能，mdp 里忘了开 couple-intramol，结果把分子内部相互作用也耦合掉……
2026-08-03
高通量分子筛选：从算力并行到结果聚合的工程化路径

高通量分子筛选：从算力并行到结果聚合的工程化路径

高通量分子筛选把”候选药物分子筛选”的层级思路放大到材料、催化剂、吸附剂领域，难点从”算法准不准”……
2026-07-30
GROMACS分子动力学模拟：从建模到轨迹分析完整流程

GROMACS分子动力学模拟：从建模到轨迹分析完整流程

一、背景与需求 gromacs 分子动力学模拟是材料科学和生物物理领域使用最广泛的MD软件之一。GROMACS开源、高效、并行性好，在处……
2026-07-28
Gromacs代算 — 科研用户的GROMACS分子动力学外包服务选型与质量验收指南

Gromacs代算 — 科研用户的GROMACS分子动力学外包服务选型与质量验收指南

Gromacs代算的市场现状是混乱的。淘宝上200一篇的MD代做、QQ群里号称”三天交付”的个人接单、到正规科研服务公司的……
2026-07-21
高斯加速分子动力学模拟 — GaMD突破常规MD采样瓶颈的原理与实践

高斯加速分子动力学模拟 — GaMD突破常规MD采样瓶颈的原理与实践

高斯加速分子动力学模拟（Gaussian accelerated Molecular Dynamics, GaMD）的核心痛点是解决”等不到”的问题。常……
2026-07-20
GROMACS计算自由能 — 从伞形采样到结合自由能的实战复盘

GROMACS计算自由能 — 从伞形采样到结合自由能的实战复盘

GROMACS计算自由能在分子模拟中占据特殊地位——它回答的不是”结构是什么”而是”结合有多强”。从药物-靶……
2026-07-15
高斯分子动力学模拟 — 从Born-Oppenheimer MD到轨道动力学的方法复盘

高斯分子动力学模拟 — 从Born-Oppenheimer MD到轨道动力学的方法复盘

高斯分子动力学模拟是指利用Gaussian程序包进行从头算分子动力学（AIMD）计算。与经典MD用力场描述原子间相互作用不同，高斯分……
2026-07-15
Gromacs模拟计算：从建模到自由能的完整经验指南

Gromacs模拟计算：从建模到自由能的完整经验指南

GROMACS不仅是一个MD引擎，更是一套完整的分子模拟工具链——从力场参数化、拓扑生成到自由能计算，每个环节都有专业工具支持。……
2026-07-07
GROMACS分子动力学模拟：生物分子实战经验全分享

GROMACS分子动力学模拟：生物分子实战经验全分享

GROMACS是生物分子模拟领域的王者——蛋白质折叠、药物-靶点结合、膜动力学，几乎所有生物物理计算都用GROMACS。相比LAMMPS擅长……
2026-07-07
材料拉伸计算：有限元方法与力学性能分析

材料拉伸计算：有限元方法与力学性能分析

材料拉伸是评价材料力学性能最基本和最重要的试验方法。通过拉伸试验可以获取材料的屈服强度、抗拉强度、延伸率、弹性模量等关……
2026-07-06
GROMACS分子动力学模拟：从力场选择到自由能计算的完整工作流

GROMACS分子动力学模拟：从力场选择到自由能计算的完整工作流

GROMACS（GROningen MAchine for Chemical Simulations）是生物分子模拟社区使用最广泛的分子动力学（MD）软件之一，以其对蛋……
2026-07-02
GROMACS计算自由能：FEP全流程参数优化与膜蛋白体系的特殊处理

GROMACS计算自由能：FEP全流程参数优化与膜蛋白体系的特殊处理

不少用户在委托GROMACS计算自由能相关计算任务时，都会提出一个共性问题：FEP计算需要多长时间？λ窗口设置多少个才够？结果误……
2026-06-29
分子动力学模拟GROMACS完整流程：力场选择、平衡与轨迹分析方法

分子动力学模拟GROMACS完整流程：力场选择、平衡与轨迹分析方法

项目组在对一个激酶蛋白与抑制剂复合物体系进行分子动力学模拟gromacs时，经历了一段让人神经紧绷的调试过程。体系包含约42000……
2026-06-25
大分子分子动力学模拟：三链蛋白体系骨架涨落与溶剂可及表面积演化

大分子分子动力学模拟：三链蛋白体系骨架涨落与溶剂可及表面积演化

本项目对一条 158 残基蛋白进行 1 μs 全原子分子动力学模拟，力场 AMBER ff14SB，水模型 TIP3P，三个独立 500 ns 副本。分析骨……
2026-09-16
lammps计算结合能

lammps计算结合能

项目过程：MOF-5 吸附 CO₂、CH₄、N₂ 的结合能与吸附热 客户研究 MOF-5 在气体分离中的应用，需要定量比较三种小分子在 MOF-5 ……
2026-09-08
lammps计算结合能

lammps计算结合能

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：lammps计算结合能 客户要算聚合……
2026-09-04
钙钛矿分子动力学模拟熔化行为

钙钛矿分子动力学模拟熔化行为

一、项目背景与科学问题 全无机卤化物钙钛矿CsPbBr3因优异的热稳定性与光电性能成为钙钛矿光电器件的重要候选材料，但其在高温……
2026-09-03
LAMMPS 计算粘度

LAMMPS 计算粘度

一、项目背景与科学问题 粘度是流体最重要的输运性质之一，它决定流体的流动阻力、传热传质效率与润滑性能，在化工、能源、微……
2026-08-31
LAMMPS 计算声子谱

LAMMPS 计算声子谱

一、项目背景与科学问题 声子谱（phonon dispersion）描述晶格振动频率随波矢的色散关系，是连接晶格动力学与宏观热物性的桥梁……
2026-08-31
LAMMPS 分子动力学模拟

LAMMPS 分子动力学模拟

一、项目背景与科学问题 纳米材料的力学性能与其块体形式存在显著差异：当材料尺寸缩小至纳米量级时，表面原子比例急剧增加、……
2026-08-31
范德华力模拟计算

范德华力模拟计算

一、项目背景与科学问题 范德华力（van der Waals force）是原子与分子间普遍存在的弱相互作用，源于瞬时偶极涨落的关联，是惰……
2026-08-27
分子动力学模拟粗粒化

分子动力学模拟粗粒化

全原子 MD 算高分子，原子数动辄几十万、时间卡在 ns，想看相分离或自组装这种 μs–ms 过程基本没戏。我这个项目客户的高分子体……
2026-08-21
lammps粘度计算

lammps粘度计算

流体输运性质里，粘度是工业计算和材料设计常用的参数，但实验测高温或特殊体系的粘度往往很贵。我这个项目客户想算一种高温润……
2026-08-21
lammps计算热导率

lammps计算热导率

这张图是本项目用 LAMMPS 算某种材料热导率的两种方法对比：左边是 NEMD（非平衡分子动力学）的温度梯度曲线，右边是 Green-Ku……
2026-08-20
LAMMPS计算气体分子在固体表面吸附能的脚本编写

LAMMPS计算气体分子在固体表面吸附能的脚本编写

LAMMPS吸附能计算的基本思路 与VASP通过量子力学波函数计算能量不同，LAMMPS用经典力场计算原子间相互作用能。吸附能的公式相……
2026-08-17
LAMMPS计算吸附能

LAMMPS计算吸附能

LAMMPS吸附能计算的基本思路 与VASP通过量子力学波函数计算能量不同，LAMMPS用经典力场计算原子间相互作用能。吸附能的公式相……
2026-08-13
粗粒化分子动力学模拟

粗粒化分子动力学模拟

粗粒化分子动力学模拟，是每一个被全原子模拟的算力和时间逼到墙角的人必然会转向的出路。我刚做生物膜那会儿，想看一个膜蛋白……
2026-08-06
lammps计算声子谱

lammps计算声子谱

lammps计算声子谱，是每一个想在力场精度下快速拿到晶格振动信息的人会走的一条务实路线。我刚接触声子那会儿，默认就是 Phono……
2026-08-06
lammps计算rdf

lammps计算rdf

lammps计算rdf是分子动力学里最基础也最容易被误读的分析。我第一次算水的g(r)，在r=0附近冒出一个不该有的峰，以为发现了新结……
2026-08-04
径向分布函数模拟计算

径向分布函数模拟计算

我第一次做 径向分布函数模拟计算是分析一段 10 ns 水的轨迹，bin 宽度设了 0.1 Å，画出来的 g_OO(r) 锯齿状乱抖，我还以为体……
2026-08-03
径向分布函数理论计算

径向分布函数理论计算

我第一次做 径向分布函数理论计算是写水模型的 method 部分，审稿人问”你的 g_OO(r) 第一峰对应几配位”，我脱口而……
2026-08-03
lammps计算自由能

lammps计算自由能

我第一次做 lammps计算自由能是把 A 原子慢慢”变”成 B 原子算固溶形成自由能，用 TI 积分 ⟨∂U/∂λ⟩，但忘了 LAMMPS……
2026-08-03
拉伸动力学模拟

拉伸动力学模拟

我做 拉伸动力学模拟 最初是客户想知道一个蛋白域被 AFM 针头拽开要多少力。我设了个 0.1 nm/ns 的拉速跑了一发，给出 200 pN……
2026-07-31
高分子动力学模拟：链构象标度律与扩散区制分析

高分子动力学模拟：链构象标度律与扩散区制分析

本项目采用粗粒化分子动力学模拟一条 500 珠的高分子链在良溶剂与 θ 溶剂中的动力学。力场为 Kremer-Grest 珠簧模型，截断半径……
2026-09-16
蛋白酶体分子模拟

蛋白酶体分子模拟

项目过程：20S 蛋白酶体 500 ns 全原子动力学 客户研究蛋白酶体抑制剂，需要了解 20S 蛋白酶体在溶液中的动力学行为，特别是 β……
2026-09-08
粗粒度分子动力学模拟

粗粒度分子动力学模拟

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：粗粒度分子动力学模拟 客户要做……
2026-09-04
高分子分子动力学模拟

高分子分子动力学模拟

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：高分子分子动力学模拟 客户要做……
2026-09-04
热力学模拟熔化焓

热力学模拟熔化焓

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：热力学模拟熔化焓 客户要的是纯……
2026-09-04
分子动力学辐照模拟

分子动力学辐照模拟

一、项目背景与科学问题 核反应堆结构材料长期服役于高通量中子辐照环境，辐照产生的级联碰撞会在材料中引入大量空位与间隙原……
2026-09-03
amber计算蛋白质折叠动力学

amber计算蛋白质折叠动力学

一、项目背景与科学问题 蛋白质的氨基酸序列如何折叠为确定的三维结构，是分子生物学的核心问题之一。微型蛋白Trp-cage由20个……
2026-09-03
势函数理论计算

势函数理论计算

一、项目背景与科学问题 分子动力学（MD）模拟的可靠性从根本上取决于势函数（interatomic potential）的精度。势函数以解析形……
2026-09-02
MD 分子动力学计算模拟

MD 分子动力学计算模拟

一、项目背景与科学问题 蛋白质在溶液中的三维结构与构象动力学决定其生物学功能。溶菌酶（lysozyme）是结构生物学研究的经典……
2026-08-31
钙钛矿分子动力学模拟

钙钛矿分子动力学模拟

一、项目背景与科学问题 有机-无机杂化钙钛矿（如 CH₃NH₃PbI₃，MAPbI₃）凭借优异的光电性能（高吸收系数、长载流子寿命、低成……
2026-08-31
晶体分子动力学模拟

晶体分子动力学模拟

一、项目背景与科学问题 晶体分子动力学（MD）模拟以原子/分子为基本单元，通过数值积分运动方程追踪粒子在晶体势场中的运动轨……
2026-08-28
蛋白酶体分子模拟

蛋白酶体分子模拟

一、项目背景与科学问题 20S 蛋白酶体是真核细胞中负责蛋白质降解的核心分子机器，由四个堆叠的七元环（αββα）组成，形成中空……
2026-08-28
从头计算分子动力学模拟

从头计算分子动力学模拟

一、项目背景与科学问题 从头算分子动力学（AIMD，Born-Oppenheimer MD）将第一性原理电子结构计算与分子动力学轨迹传播相结合……
2026-08-28
GPCR 分子动力学模拟

GPCR 分子动力学模拟

一、项目背景与科学问题 G 蛋白偶联受体（GPCR）是人类基因组中最大的膜蛋白家族，介导约三分之一上市药物的药理作用。β₂-肾上……
2026-08-28
分子动力学粗粒化模拟

分子动力学粗粒化模拟

一、项目背景与科学问题 生物膜是细胞与细胞器功能的基础，其结构性质（如单脂面积、膜厚度、脂质有序度）与膜蛋白功能密切相……
2026-08-27
分子动力学模拟自由能计算

分子动力学模拟自由能计算

结合案例图分析，本文以这个构象转变自由能项目为例，讲 umbrella sampling 的窗口与重叠。这是一个构象转变自由能测定项目。……
2026-08-26
蛋白结合位点模拟

蛋白结合位点模拟

结合案例图分析，本文以这个抑制剂-靶点结合模式项目为例，讲动态信息和能量分解怎么找真关键残基。这是一个抑制剂-靶点结合模……
2026-08-26
高通量分子筛选

高通量分子筛选

结合案例图分析，本文以这个催化剂先导化合物筛选项目为例，讲前置虚拟筛选为什么比硬算重要。这是一个催化剂先导化合物虚拟筛……
2026-08-26
大分子分子动力学模拟

大分子分子动力学模拟

结合案例图分析，第一张案例图横轴是模拟时间（ns），纵轴是RMSD（Å）。黑色曲线代表apo态（无配体），红色曲线代表holo态（配……
2026-08-25
MOE分子模拟

MOE分子模拟

结合案例图分析，第一张案例图是配体周围空间的静电势映射。红色区域表示负静电势（亲核/富电子），蓝色区域表示正静电势（亲……
2026-08-25
多肽和蛋白结合：多肽-蛋白界面接触图谱与 MM-GBSA 能量分解

多肽和蛋白结合：多肽-蛋白界面接触图谱与 MM-GBSA 能量分解

本项目研究一条 14 残基多肽与目标蛋白的结合界面。通过 300 ns 显水 MD，提取 300 帧做 MM-GBSA 能量分解，并绘制界面接触图……
2026-09-16
蛋白分子模拟对接：PD-1/PD-L1 界面结合模式与能量分解

蛋白分子模拟对接：PD-1/PD-L1 界面结合模式与能量分解

本项目通过分子对接与分子动力学模拟研究 PD-1 与 PD-L1 蛋白的相互作用。采用 ZDOCK/Rosetta 对接产生 54000 个刚体取向，经 ……
2026-09-16
蛋白分子模拟对接

蛋白分子模拟对接

项目过程：蛋白-蛋白对接与能量漏斗分析 客户需要预测两个已知结构的蛋白如何形成复合物，没有实验复合物结构。他的目标是得到……
2026-09-08
蛋白结合位点预测

蛋白结合位点预测

项目过程：螺旋蛋白的可药性口袋识别 客户拿到一条新解析的螺旋蛋白结构，不知道小分子该往哪里结合。他希望能先预测出潜在的……
2026-09-08
分子对接筛选

分子对接筛选

项目过程：针对 EGFR 激酶的 2100 分子虚拟筛选 客户有一批从化合物库中挑选的 2100 个类药分子，想快速筛选出可能结合 EGFR ……
2026-09-08
生物分子结构预测

生物分子结构预测

项目过程：四螺旋束蛋白的结构预测与质量评估 客户有一条新测序的蛋白序列，没有实验结构，想用计算预测一个可靠的三维模型，……
2026-09-08
蛋白修饰位点预测

蛋白修饰位点预测

项目过程：300 残基底物磷酸化位点的机器学习预测 客户拿到一条 300 残基的底物蛋白序列，想快速定位可能的磷酸化位点。实验上……
2026-09-08
分子对接预测

分子对接预测

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：分子对接预测 客户手上有 15 个……
2026-09-04
多糖分子对接

多糖分子对接

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：多糖分子对接 客户研究的是寡糖……
2026-09-04
小分子对接模拟

小分子对接模拟

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：小分子对接模拟 客户要做的是一……
2026-09-04
分子对接和动力学模拟

分子对接和动力学模拟

一、项目背景与科学问题 计算机辅助药物设计通过在分子水平预测配体与靶蛋白的结合模式来加速先导化合物发现。分子对接可以快……
2026-09-03
蛋白质分子动力学模拟HIV-1蛋白酶

蛋白质分子动力学模拟HIV-1蛋白酶

一、项目背景与科学问题 HIV-1蛋白酶是艾滋病病毒复制周期中的关键酶，负责切割病毒多聚蛋白前体，是抗艾滋病药物的核心靶点。……
2026-09-03
分子对接自由能计算

分子对接自由能计算

一、项目背景与科学问题 结合自由能（binding free energy）是定量评价蛋白-配体相互作用强度的核心热力学量，直接关联药物分……
2026-08-31
核酸小分子对接

核酸小分子对接

一、项目背景与科学问题 核酸（DNA/RNA）是许多小分子药物的作用靶点。小分子通过与 DNA 双螺旋的特定位点结合，可抑制基因转……
2026-08-28
多肽分子对接模拟

多肽分子对接模拟

一、项目背景与科学问题 多肽-受体相互作用在信号转导、免疫识别与药物设计中扮演核心角色。多肽药物因高特异性与低毒性受到广……
2026-08-27
分子对接位点

分子对接位点

结合案例图分析，本文以这个新靶点口袋识别项目为例，讲结合位点识别为什么是对接前置。这是一个新药靶点结合位点识别项目。客……
2026-08-26
多糖分子对接

多糖分子对接

结合案例图分析，第一张案例图是一个蓝色椭圆表示的lectin domain，里面标注了几个氨基酸残基位点（aa）。一端是Glc-Man二糖链……
2026-08-25
分子对接结合能

分子对接结合能

结合案例图分析，第一张案例图展示的是配体骨架，碳原子为深色圆球，氮为蓝色，氧为红色。可以看到配体与周围口袋残基形成了多……
2026-08-25
alphafold2分子对接

alphafold2分子对接

我做过一个用 AlphaFold2 预测结构再做分子对接的项目。客户没有蛋白晶体结构，只有序列，但他想知道小分子能不能结合到某个潜……
2026-08-24
多对多分子对接

多对多分子对接

普通对接是一对一（一个配体对一个受体），但实际药物发现里常遇到”一组化合物（比如同源蛋白家族）对一组靶标”的……
2026-08-21
多肽自组装模拟：二苯丙氨酸纳米管成核自由能与临界核尺寸

多肽自组装模拟：二苯丙氨酸纳米管成核自由能与临界核尺寸

本项目用 well-tempered metadynamics 模拟二苯丙氨酸（diphenylalanine, FF）在 12 mM 有效浓度下的自组装成核过程。体系 48 ……
2026-09-16
小分子化合物筛选：药效团匹配与 Tanimoto 相似度聚类

小分子化合物筛选：药效团匹配与 Tanimoto 相似度聚类

本项目基于某靶点结合口袋构建四特征药效团模型（氢键供体 HBD、氢键受体 HBA、疏水 HYD、芳环 AR），从商业化合物库中筛选候……
2026-09-16
小分子自组装模拟：SDS 胶束形成动力学与临界胶束浓度

小分子自组装模拟：SDS 胶束形成动力学与临界胶束浓度

本项目用粗粒化 MARTINI 力场模拟 64 个 SDS 单体在水溶液中的自组装。体系共 310 K，用 GROMACS 运行 500 ns，分析径向密度分……
2026-09-16
蛋白相互作用模拟

蛋白相互作用模拟

项目过程：蛋白复合物 A-B 的 100 ns 分子动力学 客户做抗体-抗原相互作用研究，需要定量判断复合物 A-B 的结合强度，以及结合……
2026-09-08
分子间互相预测

分子间互相预测

结合案例图分析，我把这个项目的完整过程、参数设置、结果解读和踩坑经验整理如下。 项目过程：分子间互相预测 客户要预测两个……
2026-09-04
分子自组装模拟

分子自组装模拟

一、项目背景与科学问题 两亲性分子（如表面活性剂、嵌段共聚物）在水溶液中可自组装形成胶束、囊泡与液晶相等纳米结构。胶束……
2026-08-28
计算模拟分子组装

计算模拟分子组装

一、项目背景与科学问题 嵌段共聚物（block copolymer）由化学性质不同的两段或多段聚合物链共价连接而成，其微相分离可自发组……
2026-08-28
分子自组装计算

分子自组装计算

一、项目背景与科学问题 表面活性剂分子（如十二烷基硫酸钠，SDS）在溶液中超过一定浓度后会自发组装形成胶束，这一临界浓度称……
2026-08-27
分子动力学模拟氢键

分子动力学模拟氢键

结合案例图分析，本文以这个含羟基体系氢键网络项目为例，讲氢键定义和 RDF 怎么用。这是一个含羟基体系氢键网络研究项目。客……
2026-08-26
小分子自组装动力学模拟

小分子自组装动力学模拟

结合案例图分析，本文以这个两亲分子胶束形成项目为例，讲自组装模拟的采样与力场坑。这是一个两亲性小分子胶束形成研究项目。……
2026-08-26
分子动力学建模

分子动力学建模

结合案例图分析，本文以这个肽链水溶液动力学项目为例，讲 MD 建模里决定成败的细节。这是一个生物分子溶液动力学项目的建模工……
2026-08-26
高通量分子筛选

高通量分子筛选

高通量分子筛选（HTVS）的核心是用最低的单体系成本，在最短时间内从超大规模化合物库中剔除明显无效的分子。本项目在虚拟筛选……
2026-08-18
计算模拟分子组装

计算模拟分子组装

计算模拟分子组装是连接分子相互作用和宏观材料性能的桥梁——你想知道两亲分子怎么排成胶束、多肽怎么缠成纤维，光靠实验观测往……
2026-08-11
分子自组装模拟分析

分子自组装模拟分析

分子自组装模拟分析，是每一个想用模拟把”这些分子怎么自己拼成有序结构”看明白的人，迟早要碰的跨尺度难题。我刚……
2026-08-10
小分子自组装动力学模拟

小分子自组装动力学模拟

小分子自组装动力学模拟，是每一个想看清楚”一堆分子怎么自己排成有序结构”的人最着迷也最头疼的课题。我刚做超分……
2026-08-06
自组装分子结构预测

自组装分子结构预测

做 自组装分子结构预测 之前，我天真地想用全原子 MD 直接看一个两亲肽怎么聚成纤维。结果 200 ns 只看到两三个分子犹豫要不要……
2026-07-31
分子自组装计算 — 氢键网络驱动的超分子层级组装模拟

分子自组装计算 — 氢键网络驱动的超分子层级组装模拟

为什么有些超分子体系能从单分子一直组装到宏观凝胶 脲基嘧啶酮（UPy）是超分子化学中的明星分子——它通过四重氢键形成极强的二……
2026-07-17
分子自组装服务 — 临界胶束浓度CMC的模拟预测方法

分子自组装服务 — 临界胶束浓度CMC的模拟预测方法

CMC预测为什么不能靠”跑一跑看” 临界胶束浓度（CMC）是分子自组装服务中最常被咨询的参数之一。无论是表面活性剂……
2026-07-17
多肽自组装计算 — 短肽β-sheet自组装的粗粒化MD模拟方法

多肽自组装计算 — 短肽β-sheet自组装的粗粒化MD模拟方法

为什么模拟短肽自组装比想象中难得多 短肽自组装在生物材料、药物递送和纳米技术中有着广泛的应用前景。一个经典的例子是二苯……
2026-07-17
分子自组装服务 — 从胶束形成到超分子结构的模拟实战

分子自组装服务 — 从胶束形成到超分子结构的模拟实战

分子自组装服务是计算化学中一个独特的方向——不模拟单个分子的行为，而是模拟大量分子如何自发组织成有序结构。从表面活性剂胶……
2026-07-15
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