行业新闻
第一性原理
手机版
关于我们
热门搜索：
模拟计算，理论计算
首页
第一性原理
cp2k计算
dft计算
Gaussian计算
MS计算
VASP计算
分子动力学模拟
gromacs计算
lammps计算
VASP计算
分子对接
分子自组装
有限元仿真
abaqus仿真
ansys仿真
comsol仿真
fluent仿真
力学仿真
流体/流动仿真
多相流仿真
科研测试
AFM检测
SEM检测
TEM检测
相图计算
三元相图
二元相图
混合焓计算
相成分计算
热熔计算
机器学习
案例分享
dft计算案例
fea计算案例
MD计算案例
模拟计算案例
行业新闻
分子动力学
有限元仿真
第一性原理
其他新闻
lammps计算rdf
分子对接模拟
分子对接与动力学模拟
界面分子动力学模拟
gromacs计算
lammps计算
VASP计算
分子对接
分子自组装
gromacs自由能计算
我第一次做 gromacs自由能计算是算一个药物分子的水合自由能，mdp 里忘了开 couple-intramol，结果把分子内部相互作用也耦合掉……
2026-08-03
高通量分子筛选：从算力并行到结果聚合的工程化路径
高通量分子筛选把”候选药物分子筛选”的层级思路放大到材料、催化剂、吸附剂领域，难点从”算法准不准”……
2026-07-30
GROMACS分子动力学模拟：从建模到轨迹分析完整流程
一、背景与需求 gromacs 分子动力学模拟是材料科学和生物物理领域使用最广泛的MD软件之一。GROMACS开源、高效、并行性好，在处……
2026-07-28
Gromacs代算 — 科研用户的GROMACS分子动力学外包服务选型与质量验收指南
Gromacs代算的市场现状是混乱的。淘宝上200一篇的MD代做、QQ群里号称”三天交付”的个人接单、到正规科研服务公司的……
2026-07-21
高斯加速分子动力学模拟 — GaMD突破常规MD采样瓶颈的原理与实践
高斯加速分子动力学模拟（Gaussian accelerated Molecular Dynamics, GaMD）的核心痛点是解决”等不到”的问题。常……
2026-07-20
GROMACS计算自由能 — 从伞形采样到结合自由能的实战复盘
GROMACS计算自由能在分子模拟中占据特殊地位——它回答的不是”结构是什么”而是”结合有多强”。从药物-靶……
2026-07-15
高斯分子动力学模拟 — 从Born-Oppenheimer MD到轨道动力学的方法复盘
高斯分子动力学模拟是指利用Gaussian程序包进行从头算分子动力学（AIMD）计算。与经典MD用力场描述原子间相互作用不同，高斯分……
2026-07-15
Gromacs模拟计算：从建模到自由能的完整经验指南
GROMACS不仅是一个MD引擎，更是一套完整的分子模拟工具链——从力场参数化、拓扑生成到自由能计算，每个环节都有专业工具支持。……
2026-07-07
GROMACS分子动力学模拟：生物分子实战经验全分享
GROMACS是生物分子模拟领域的王者——蛋白质折叠、药物-靶点结合、膜动力学，几乎所有生物物理计算都用GROMACS。相比LAMMPS擅长……
2026-07-07
材料拉伸计算：有限元方法与力学性能分析
材料拉伸是评价材料力学性能最基本和最重要的试验方法。通过拉伸试验可以获取材料的屈服强度、抗拉强度、延伸率、弹性模量等关……
2026-07-06
GROMACS分子动力学模拟：从力场选择到自由能计算的完整工作流
GROMACS（GROningen MAchine for Chemical Simulations）是生物分子模拟社区使用最广泛的分子动力学（MD）软件之一，以其对蛋……
2026-07-02
GROMACS计算自由能：FEP全流程参数优化与膜蛋白体系的特殊处理
不少用户在委托GROMACS计算自由能相关计算任务时，都会提出一个共性问题：FEP计算需要多长时间？λ窗口设置多少个才够？结果误……
2026-06-29
分子动力学模拟GROMACS完整流程：力场选择、平衡与轨迹分析方法
项目组在对一个激酶蛋白与抑制剂复合物体系进行分子动力学模拟gromacs时，经历了一段让人神经紧绷的调试过程。体系包含约42000……
2026-06-25
GROMACS计算自由能：膜蛋白-配体FEP结合能中电荷-范德华解耦与BAR收敛
一个GPCR-拮抗剂体系的结合自由能计算项目，初始FEP设置在20个等间距λ窗口上跑了每窗口2 ns，BAR给出的ΔG值是-8.3 ± 2.1 kcal/……
2026-06-23
分子动力学模拟计算：GROMACS蛋白质-配体复合物稳定性验证全流程
分子动力学模拟计算是对接结果的时间维度延伸——对接给出静态结合构象，MD在纳秒到微秒时间尺度上追踪体系演化，验证结合模式能……
2026-06-19
GROMACS分子动力学模拟：一个离子液体体系中锂离子传输的机理研究
离子液体作为新型电解质的潜力已经不需要再论证，但锂离子在离子液体中的传输行为比传统碳酸酯电解质复杂得多——高黏度、强配位……
2026-06-16
全原子分子动力学模拟原理：从力场参数到轨迹分析的完整链条
全原子分子动力学模拟的原理，教科书上讲得清楚——牛顿第二定律逐帧积分，每个原子受力来自力场的解析表达式。但真正上手跑一个……
2026-06-15
蛋白质-配体结合自由能的MM/PBSA计算中采样不足如何影响结果
MM/PBSA在药物设计里用得非常多——把一个蛋白-配体复合物的MD轨迹拿出来，对每个帧算一次分子力学能+溶剂化自由能，取平均，复……
2026-06-09
聚合物玻璃化转变温度的分子动力学模拟——Tg计算中五个容易忽略的收敛问题
聚合物Tg的MD模拟逻辑上很直接：在不同温度下跑NPT平衡，把比体积对温度做图，两条直线的交点就是Tg。这个逻辑本身没毛病，但……
2026-06-09
高斯Anharmonic计算：为什么谐振近似会误导你
做振动光谱计算的人，大多在某个阶段被谐振近似的结果搞失望过。算出来的红外频率，和实验值稳定地差5-10%，氢能键体系甚至能……
2026-06-08
lammps计算rdf
lammps计算rdf是分子动力学里最基础也最容易被误读的分析。我第一次算水的g(r)，在r=0附近冒出一个不该有的峰，以为发现了新结……
2026-08-04
径向分布函数模拟计算
我第一次做 径向分布函数模拟计算是分析一段 10 ns 水的轨迹，bin 宽度设了 0.1 Å，画出来的 g_OO(r) 锯齿状乱抖，我还以为体……
2026-08-03
径向分布函数理论计算
我第一次做 径向分布函数理论计算是写水模型的 method 部分，审稿人问”你的 g_OO(r) 第一峰对应几配位”，我脱口而……
2026-08-03
lammps计算自由能
我第一次做 lammps计算自由能是把 A 原子慢慢”变”成 B 原子算固溶形成自由能，用 TI 积分 ⟨∂U/∂λ⟩，但忘了 LAMMPS……
2026-08-03
拉伸动力学模拟
我做 拉伸动力学模拟 最初是客户想知道一个蛋白域被 AFM 针头拽开要多少力。我设了个 0.1 nm/ns 的拉速跑了一发，给出 200 pN……
2026-07-31
计算化学模拟：从量子化学到分子动力学的工具选择与方法边界
计算化学模拟最容易被新人问的问题是”用什么软件”，但真正该问的是”我要回答什么尺度的什么问题”。从……
2026-07-30
分子动力学模拟势函数 — 从Lennard-Jones到机器学习势的选型艺术
一、背景：势函数选错，一切归零 势函数是分子动力学模拟的灵魂。经典MD不求解薛定谔方程，而是用经验势函数（Empirical Poten……
2026-07-24
LAMMPS计算表面张力 — 压力张量法与测试面积法的工程实践
表面张力看起来是个简单的物理量——单位面积上的自由能——但用分子动力学模拟精确计算它，远比你想象的复杂。一个典型的场景：你……
2026-07-21
LAMMPS分子动力学模拟 — 从in文件编写到后处理的全链路工程复盘
如果你在课题组刚接手LAMMPS分子动力学模拟的工作，大概率会先面对一叠师兄留下的in文件——几百行命令，变量嵌套变量，注释全是……
2026-07-21
LAMMPS计算服务 — 从in文件定制到并行效率优化的全流程外包方案
LAMMPS计算服务和其他MD代算有一个本质区别：LAMMPS没有图形界面，所有操作都通过in脚本来控制。这意味着LAMMPS计算服务的质量……
2026-07-21
分子动力学模拟拉伸 — 单轴拉伸应力-应变曲线的原子级获取
分子动力学模拟拉伸的结果和宏观拉伸实验看起来相似——都是一条先升后降的应力-应变曲线——但产生这条曲线背后的物理完全不同。……
2026-07-20
分子动力学模拟粗粒化 — 从全原子到MARTINI的映射策略与精度验证
分子动力学模拟粗粒化在生物模拟领域讨论得比较多（膜蛋白、病毒衣壳），但在材料科学和软物质——聚合物共混物的相分离、胶束的……
2026-07-20
分子结构预测 — AlphaFold3与MD联用的蛋白质动态构象系综采样
AlphaFold3给了你一个答案，但你确定它是对的答案吗 2024年AlphaFold3的发布让分子结构预测进入了一个新纪元——蛋白质-配体、蛋……
2026-07-17
平衡分子动力学模拟 — NVT与NPT系综选择的十个常见误区
一个”很简单”的膜蛋白体系为什么跑了三个月还没平衡 至今回忆起来仍觉得那个项目是最让人挫败的——一个GPCR膜蛋白……
2026-07-17
均方根模拟计算 — RMSD/RMSF在分子动力学轨迹分析中的应用
均方根模拟计算——或者更精确地说，RMSD（均方根偏差）和RMSF（均方根涨落）——是分子动力学轨迹分析中最基础、但也最容易被误读……
2026-07-16
粗粒化模拟 — 从全原子到MARTINI力场的尺度跃迁实战
粗粒化模拟是解决生物分子模拟中时间尺度瓶颈的核心手段。全原子分子动力学跑一个膜蛋白体系，速度大约50-100 ns/天（单GPU）……
2026-07-16
LAMMPS粗粒化建模 — 从全原子映射到粗粒化力场拟合的实战流程
LAMMPS粗粒化建模是将复杂全原子体系简化为粗粒化模型的过程。与直接使用MARTINI等现成力场不同，LAMMPS粗粒化建模通常需要针……
2026-07-15
LAMMPS计算自由能 — 从热力学积分到伞形采样的实战方法
LAMMPS计算自由能与GROMACS有所不同——LAMMPS更侧重于材料科学体系（金属、陶瓷、高分子），而非生物分子。LAMMPS计算自由能的……
2026-07-15
LAMMPS扩散系数计算 — 从均方位移到输运性质的实战方法
LAMMPS扩散系数计算是分子动力学后处理分析中最常见的操作之一。扩散系数表征了粒子在体系中的迁移能力，对液体输运、离子传导……
2026-07-15
LAMMPS计算径向分布函数 — 从命令设置到结构解读的实战指南
LAMMPS计算径向分布函数是分子动力学分析中最基础也最常用的操作之一。径向分布函数g(r)描述了以某个原子为中心、距离r处找到……
2026-07-15
范德华力模拟计算
我第一次做 范德华力模拟计算是算一个有机液体的密度，cutoff 只设了 10 Å 又没开长程色散校正，算出来密度比实验低 4%，导师……
2026-08-03
自由能模拟计算
我第一次做 自由能模拟计算是给一个酶做单点突变的 ΔΔG 预测，只设了 6 个 λ 窗口，算出来的数值误差棒比效应还大，根本没法下……
2026-08-03
钙钛矿分子动力学模拟：力场参数化与相变分析的实战经验
钙钛矿材料（ABO₃型）的相变行为是凝聚态物理里的经典问题。BaTiO₃从立方相到四方相的铁电相变发生在393K，SrTiO₃的反铁畸变相……
2026-07-29
vasp计算分子动力学模拟：从头算分子动力学方法与实战
一、背景与需求 vasp计算分子动力学模拟是连接电子结构与动态行为的关键桥梁。传统的DFT静态计算给出的是0K下的基态结构，但材……
2026-07-28
生物分子动力学模拟：蛋白质/核酸/膜体系模拟方法
一、背景与需求 生物分子动力学模拟是理解生物大分子功能机制的核心计算手段。蛋白质的构象变化、核酸的弯曲与解链、膜蛋白在……
2026-07-28
酶分子动力学模拟：催化残基运动与底物结合分析
一、背景与需求 酶分子动力学模拟是理解酶催化机理的核心计算工具。酶催化的高效性和选择性来源于活性位点的精确定间排列和动……
2026-07-28
AIMD分子动力学模拟：第一性原理MD计算方法与应用
一、背景与需求 aimd分子动力学模拟这个话题，从第一次跑通一个64原子的Si-O体系开始，到现在已经折腾了十余年。最早是被一个……
2026-07-28
平衡分子动力学模拟：NVT/NPT系综平衡策略与判据
一、背景与需求 平衡分子动力学模拟是整个MD流程中最容易被忽视的环节。很多人急着进入生产MD，跳过平衡或平衡时间不够，导致……
2026-07-28
AMBER分子动力学模拟：生物分子力场与tleap建模详解
一、背景与需求 amber分子动力学模拟在生物分子计算领域占据独特地位。AMBER的全称是Assisted Model Building with Energy Ref……
2026-07-28
薛定谔分子动力学模拟 — Schrödinger软件中Desmond模块的实战深度复盘
一、背景：Schrödinger凭什么成为工业界标准 Schrödinger（薛定谔）软件平台在全球制药企业的计算化学部门中占据了绝对主导地……
2026-07-24
多肽分子动力学模拟 — 从短肽构象采样到蛋白-多肽识别的全流程
一、背景：多肽MD的特殊挑战 多肽是介于有机小分子和蛋白之间的”中间态”分子。它的分子动力学模拟既不像小分子那……
2026-07-24
MS分子动力学模拟 — 从建模到分析的全链路技术复盘
一、背景：MS分子动力学模拟的能力边界 在材料计算领域，MS分子动力学模拟占据了一个独特的位置：比LAMMPS更易上手，比GROMACS……
2026-07-24
MS计算分子动力学 — Materials Studio中分子动力学计算全流程复盘
一、背景：为什么选择MS做分子动力学计算 Materials Studio（以下简称MS）是国内材料科学领域装机量最高的商业软件之一。它的……
2026-07-24
分子动力学扩散模拟：从MSD计算到输运系数提取的完整路径
扩散是材料、溶液和生物膜中最基本的输运过程之一。分子动力学（MD）扩散模拟通过追踪粒子的运动轨迹，可以直接计算扩散系数——……
2026-07-22
分子动力学模拟计算：方法选择、参数配置与轨迹分析的实战框架
分子动力学模拟计算（MD Simulation）通过数值求解牛顿运动方程，追踪体系中每个原子在时间维度上的运动轨迹，从而获得体系的……
2026-07-22
分子对接动力学模拟：从构象搜索到结合稳定性验证的双阶段方法论
分子对接（Molecular Docking）和分子动力学模拟（MD Simulation）是药物设计和生物分子研究的两大核心计算工具。单独使用分子……
2026-07-22
VASP计算分子动力学模拟 — 催化反应机理的AIMD实战复盘
VASP的分子动力学模拟能力（AIMD）虽然比经典MD慢1000倍以上，但在催化机理研究中有两个无可替代的价值：第一，化学反应涉及键……
2026-07-21
VASP计算分子对接 — DFT级对接精度的实现路径与技术挑战
分子对接的主流方法是Autodock Vina、Glide这类基于力场和半经验打分函数的工具——快是真快，百万级化合物库几天跑完。但如果你……
2026-07-21
扩散系数计算 — 分子动力学中Einstein关系与Green-Kubo方法的实战对比
扩散系数计算在MD中看起来简单——算个MSD，拟合斜率，除以6——但真正做过的人都知道魔鬼在细节里。MSD线性区的选择、时间原点平……
2026-07-21
纳米材料MD模拟 — 从纳米颗粒熔点降低到纳米线拉伸力学响应的分子动力学证据
纳米材料MD模拟是计算材料科学中增长最快的方向之一。我第一次认真做纳米颗粒的MD，是因为组里做纳米金催化实验的同事跑来问我……
2026-07-21
分子对接模拟
分子对接模拟是药物虚拟筛选的第一道闸门。我刚做项目时，把一个靶点跑了三十万化合物的对接，Top100里挑了十个做实验，结果一……
2026-08-04
分子对接与动力学模拟
分子对接与动力学模拟联用，是药物设计和蛋白-配体研究里我最常用的组合拳。但很多人以为对接完了就完事，我早年也这么干，直……
2026-08-04
界面分子动力学模拟
界面分子动力学模拟是块硬骨头。我第一次算水和石墨烯的固液界面，跑完发现水分子在界面排成了怪异的双层，润湿角算出来离谱，……
2026-08-04
聚合物分子动力学模拟
聚合物分子动力学模拟最怕算完了却不像聚合物。我刚入行时用通用力场随手建了条聚乙烯链，跑完发现链缠结全无、玻璃化转变温度……
2026-08-04
分子结构预测
我第一次做 分子结构预测是给一个柔性八肽找全局最小构象，用系统搜索跑了上万个构象，挑了最低的那个去做 MD，结果 MD 一开始……
2026-08-03
分子对接大概多少钱
被问”分子对接大概多少钱”时，我最怕对方只丢一句”对接一个分子多少钱”。因为对接不是标准件——靶点要……
2026-07-31
yasara分子动力学模拟
我第一次用 yasara分子动力学模拟 是因为客户那边只有 YASARA 的 license，且想要一个”开箱即用”的蛋白-配体稳定……
2026-07-31
分子对接自组装
做 分子对接 自组装 的契机，是客户想设计一个环糊精包结一个药物分子的超分子系统。我一开始当成普通靶点对接，把药物塞进空……
2026-07-31
分子对接预测
我第一次做 分子对接预测 是把一个客户给的 200 个化合物批量 dock 到靶点，按打分排了个序交差。结果实验验证只命中 3 个，客……
2026-07-31
酶的分子对接：从活性口袋识别到催化机理验证的专项目路径
酶的分子对接是分子对接里最磨人的一类——普通蛋白只要找结合口袋，酶还得兼顾催化机理，活性中心往往柔性大、有水桥、有金属辅……
2026-07-30
候选药物分子筛选：从虚拟筛选到实验验证的递进式漏斗
候选药物分子筛选是药物发现的第一道关，但新手最容易把它做成”跑一遍对接、挑分数最高的十个”。真实项目里，对接……
2026-07-30
代做分子动力学模拟：从需求沟通到交付汇报的全流程经验
代做分子动力学模拟这几年需求暴涨，但十单里有六单卡在”需求没对齐”上——客户说”帮我模拟一下这个分子̶……
2026-07-30
蛋白与小分子互作：从分子对接到自由能验证的机理研究路径
蛋白与小分子互作是药物发现和酶调控研究的核心，但它的坑不在”算出个结合模式”，而在”算出的结合模式你敢……
2026-07-30
分子动力学结果分析：RMSD、氢键与自由能的拆解路径
分子动力学模拟跑完只是开始，真正决定一篇论文能不能站住脚的，是结果分析这一步。我用GROMACS做了十二年蛋白与小分子体系，……
2026-07-30
拉伸分子动力学模拟详解：从应力应变曲线到断裂机制的计算实战
2019年客户甩给我一个任务——预测某种高强度聚乙烯纤维的拉伸断裂强度，实验测出来是3.2 GPa，要我算出个差不多的数字就行。我……
2026-07-29
晶体分子动力学模拟：热稳定性、缺陷演化与相变行为的计算解析
做材料计算的人，多多少少都有点”完美晶体情结”——我们习惯从单胞出发，用DFT算总能、能带、态密度，然后觉得这就……
2026-07-29
水凝胶分子动力学模拟：从交联网络建模到溶胀行为预测
2019年接了一个挺特殊的项目——客户要优化一种温敏性PNIPAM水凝胶的溶胀比，实验组试了七八种交联剂配方，溶胀曲线就是不收敛。……
2026-07-29
粗粒化分子动力学模拟详解：从力场构建到生物大分子应用实战
入行头五年，我一直在用全原子分子动力学做蛋白-配体体系。那会儿觉得48核跑一周已经算”大规模”了，直到接手一个……
2026-07-29
药物分子动力学模拟：从靶点-配体结合到自由能计算的实战路径
我做药物分子动力学模拟十几年了，从早期的分子对接到现在的自由能微扰（FEP），这个领域的方法论迭代很快，但有些核心问题始……
2026-07-29
分子动力学模拟计算 — 从硬件配置到计算效率优化的全维度方案
一、背景：不是所有MD计算都一样 分子动力学模拟的计算成本跨度极大——从100个原子的AIMD在集群上跑一周，到100万个原子的粗粒……
2026-07-24
自组装分子结构预测
做 自组装分子结构预测 之前，我天真地想用全原子 MD 直接看一个两亲肽怎么聚成纤维。结果 200 ns 只看到两三个分子犹豫要不要……
2026-07-31
分子自组装计算 — 氢键网络驱动的超分子层级组装模拟
为什么有些超分子体系能从单分子一直组装到宏观凝胶 脲基嘧啶酮（UPy）是超分子化学中的明星分子——它通过四重氢键形成极强的二……
2026-07-17
分子自组装服务 — 临界胶束浓度CMC的模拟预测方法
CMC预测为什么不能靠”跑一跑看” 临界胶束浓度（CMC）是分子自组装服务中最常被咨询的参数之一。无论是表面活性剂……
2026-07-17
多肽自组装计算 — 短肽β-sheet自组装的粗粒化MD模拟方法
为什么模拟短肽自组装比想象中难得多 短肽自组装在生物材料、药物递送和纳米技术中有着广泛的应用前景。一个经典的例子是二苯……
2026-07-17
分子自组装服务 — 从胶束形成到超分子结构的模拟实战
分子自组装服务是计算化学中一个独特的方向——不模拟单个分子的行为，而是模拟大量分子如何自发组织成有序结构。从表面活性剂胶……
2026-07-15
分子自组装计算：模拟与理论方法全解析
分子自组装计算是利用计算化学与分子模拟手段研究分子自发组织成有序结构的过程，广泛应用于纳米材料、超分子化学和生物体系等……
2026-07-10
分子自组装服务：从相互作用设计到组装结构预测的计算方案
分子自组装是分子通过非共价相互作用自发组织成有序结构的过程，在超分子化学、纳米技术和生物材料领域具有核心地位。理解自组……
2026-06-30
晶体结构预测：从空间群搜索到全局最优构型的计算策略
晶体结构预测是计算材料科学中最具挑战性的研究方向之一——给定化学组成，仅凭物理原理预测稳定存在的晶体结构。这一问题的核心……
2026-06-30
Materials Studio分子动力学模拟：Forcite、Amorphous Cell与COMPASS力场实战
300 K下聚乙烯的”假结晶” Materials Studio（MS）的Forcite模块是工业界最常用的分子动力学工具之一，但”默……
2026-06-26
自组装分子结构预测方法详解：MD模拟与粗粒化模型
两亲性嵌段共聚物在选择性溶剂中的自组装行为，理论上有清晰的相图——球状胶束、柱状胶束、囊泡，各有对应的堆积参数区间。但当……
2026-06-25
计算模拟分子组装：分子动力学追踪自组装路径与有序度表征
分子自组装的迷人之处在于：不需要外部指令，分子仅靠热涨落和自身相互作用就能组织出有序结构。但”仅靠”二字背后……
2026-06-25
高通量药物筛选：虚拟筛选管线与先导化合物优化策略
高通量药物筛选项目中，项目组为一家药企做激酶抑制剂筛选，从百万级化合物库出发，经过四轮虚拟筛选和实验验证，最终获得数个……
2026-06-24
生物大分子自组装：脂质双层与蛋白质聚集的分子动力学模拟策略
生物大分子自组装是自然界中最优雅的结构形成过程——脂质分子在水中自发排列成双层膜、蛋白质从无序状态折叠成功能构象、淀粉样……
2026-06-17
自组装分子动力学模拟：两亲性嵌段共聚物的相行为预测
嵌段共聚物的自组装比小分子表面活性剂复杂得多——它的每一个”构件”本身就是一个聚合物链段，链段的长度、比例、柔……
2026-06-16
分子自组装模拟：一个表面活性剂胶束体系的微观结构分析
自组装是自然界中最精巧的组织方式之一——表面活性剂分子在溶液中自发地排列成胶束、囊泡、层状相等有序结构，不需要任何外部指……
2026-06-16
蛋白质结构预测的实践困境——从同源建模到AlphaFold的经验复盘
蛋白质结构预测这个方向，如果从1960年代的Levinthal悖论算起，已经走了六十多年。2021年AlphaFold2在CASP14上把平均GDT-TS提……
2026-06-13
CASTEP计算吸附能：平面波和原子轨道在氧化物表面吸附上的表现差在哪
CASTEP吸附能计算和VASP同属平面波DFT阵营，底层算法相近，但赝势库不同、默认参数不同、收敛行为也有微妙的差异。一个做光催……
2026-06-11
蛋白结合位点预测：从序列到口袋的精准定位
做药物设计的人，大多在结合位点预测这一步踩过坑。预测出来的口袋看着挺合理，对接进去的结合模式也说得通，结果合成出来一测……
2026-06-08
小分子自组装动力学模拟：聚集路径与形貌演化的完整追踪
小分子自组装动力学模拟这个方向，门槛不算高，但要做到真正有物理参考价值的程度，需要对自组装热力学和动力学之间的权衡有清……
2026-04-28
查看更多>>
查看更多>>
查看更多>>
查看更多>>
查看更多>>
1
VASP计算全流程：从结构优化到电子结构分析的经验总结
2
LAMMPS计算实战：从力场选择到大规模并行的经验总结
3
GROMACS计算全流程：从体系构建到成品轨迹的实操经验
4
高斯分子动力学模拟在反应路径预测中的实战复盘
5
HSE06杂化泛函能带计算优化：精度提升与计算成本平衡策略
6
界面热阻的分子动力学计算：NEMD建模策略与Green-Kubo积分的数据处理对比
每日精选
lammps计算rdf
2026-08-04
分子对接模拟
2026-08-04
分子对接与动力学模拟
2026-08-04
界面分子动力学模拟
2026-08-04
猜你喜欢
COMSOL热力耦合仿真：激光选区熔化温度场与应力场分析
自组装分子结构预测
VASP能带结构计算全流程详解：SCF参数设置到band图绘制
CO2电解理论计算：DFT自由能图与电催化选择性的计算框架
DFT计算材料：从结构预测到性质筛选的全链条工作流
精彩图片
DFT计算吉布斯自由能
Fluent流固耦合仿真：风力机叶片气动弹性响应与载荷评估
DFT计算在电池材料研究中的深度应用
SEM测试：扫描电镜的技术原理、应用场景与价格区间解析
热门标签
有限元仿真
LAMMPS计算热导率
LAMMPS计算吸附能
VASP吸附能计算
VASP计算振动频率
ANSYS电机受力仿真
DFT计算
第一性原理计算
分子动力学模拟
